115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0476 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0476  yngK protein  100 
 
 		 515 aa  1060    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2076  hypothetical protein  33.25 
 
 		 528 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1159  protein of unknown function DUF187  30.39 
 
 		 551 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6128  FenI protein  30.96 
 
 		 533 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0784566  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1414  FenI protein  32.43 
 
 		 540 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0039371  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2122  hypothetical protein  31.64 
 
 		 523 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  30.97 
 
 		 717 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2561  protein of unknown function DUF187  28.98 
 
 		 538 aa  191  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.134171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6227  hypothetical protein  30.4 
 
 		 550 aa  190  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1798  putative lipoprotein  34.05 
 
 		 427 aa  189  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0730367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1472  putative lipoprotein  33.81 
 
 		 427 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1577  hypothetical protein  33.81 
 
 		 427 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0723  protein of unknown function DUF187  31.2 
 
 		 509 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3734  protein of unknown function DUF187  30.39 
 
 		 508 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.459123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2061  hypothetical protein  33.01 
 
 		 431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00233563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2030  hypothetical protein  33.5 
 
 		 435 aa  180  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2393  fenI protein  33.33 
 
 		 551 aa  179  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5682  FenI protein  34.75 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0922  protein of unknown function DUF187  29.32 
 
 		 437 aa  179  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1956  protein of unknown function DUF187  26.68 
 
 		 534 aa  177  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0273789  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1593  protein of unknown function DUF187  29.32 
 
 		 486 aa  177  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1597  fenI protein  30.94 
 
 		 521 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0010634  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0258  fenI protein  30.94 
 
 		 521 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1973  putative lipoprotein  30.94 
 
 		 521 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1156  fenI protein  30.94 
 
 		 554 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2118  fenI protein  30.69 
 
 		 494 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115313  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2252  hypothetical protein  28.5 
 
 		 519 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1956  putative lipoprotein  30.86 
 
 		 521 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2914  hypothetical protein  28.53 
 
 		 519 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.737021 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2477  hypothetical protein  28.5 
 
 		 519 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1195  protein of unknown function DUF187  32.67 
 
 		 406 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2210  hypothetical protein  28.5 
 
 		 519 aa  174  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0607732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2416  hypothetical protein  31.46 
 
 		 519 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2289  hypothetical protein  28.5 
 
 		 519 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2356  protein of unknown function DUF187  33.09 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2268  hypothetical protein  29.12 
 
 		 519 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159912  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2156  protein of unknown function DUF187  33.33 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360071  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01950  hypothetical protein  35.52 
 
 		 447 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  29.21 
 
 		 729 aa  171  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1576  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1680  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2166  hypothetical protein  33.51 
 
 		 384 aa  171  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2104  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 404 aa  171  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01449  predicted liprotein  33.06 
 
 		 439 aa  169  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1682  putative lipoprotein  33.06 
 
 		 404 aa  170  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01462  hypothetical protein  33.06 
 
 		 439 aa  169  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2396  protein of unknown function DUF187  28.57 
 
 		 532 aa  170  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.00000000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1754  putative lipoprotein  33.06 
 
 		 439 aa  169  9e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2557  hypothetical protein  27.72 
 
 		 519 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.190128  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3506  protein of unknown function DUF187  28.5 
 
 		 547 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1788  hypothetical protein  29.44 
 
 		 517 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1822  hypothetical protein  31.79 
 
 		 442 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0539291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2494  hypothetical protein  27.98 
 
 		 519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5345  protein of unknown function DUF187  31.36 
 
 		 570 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0031  hypothetical protein  31.12 
 
 		 393 aa  163  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110752  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  33.89 
 
 		 669 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0802  hypothetical protein  32.45 
 
 		 451 aa  160  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4123  protein of unknown function DUF187  30.33 
 
 		 481 aa  160  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.543211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5534  hypothetical protein  28.5 
 
 		 676 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_002950  PG0061  yngK protein  31.19 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2822  hypothetical protein  32.11 
 
 		 521 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4428  protein of unknown function DUF187  30.77 
 
 		 540 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.998711  normal  0.0596861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1451  hypothetical protein  30.28 
 
 		 393 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00978092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2221  protein of unknown function DUF187  28.16 
 
 		 997 aa  153  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0753  hypothetical protein  33.23 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1770  protein of unknown function DUF187  30.38 
 
 		 538 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1354  hypothetical protein  30.73 
 
 		 431 aa  144  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14222  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4809  hypothetical protein  27.95 
 
 		 493 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4145  protein of unknown function DUF187  30.03 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.227733 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1310  hypothetical protein  30.46 
 
 		 409 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1349  protein of unknown function DUF187  26.96 
 
 		 508 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03377  YngK protein  32.4 
 
 		 378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2775  protein of unknown function DUF187  25.15 
 
 		 605 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000508646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0631  hypothetical protein  26.39 
 
 		 906 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.835872 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2257  hypothetical protein  27.88 
 
 		 490 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  27.11 
 
 		 406 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3463  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1099 aa  107  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.639127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0321  protein of unknown function DUF187  26.86 
 
 		 911 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.140793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  26.55 
 
 		 380 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3629  protein of unknown function DUF187  25.65 
 
 		 906 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2484  protein of unknown function DUF187  25.65 
 
 		 906 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.979378 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3564  protein of unknown function DUF187  25.72 
 
 		 535 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.463453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2542  protein of unknown function DUF187  25.72 
 
 		 535 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1072  hypothetical protein  26.08 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0972168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3137  hypothetical protein  25.63 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0133  hypothetical protein  27.17 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288293  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2650  hypothetical protein  24.38 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517664  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  24.74 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2134  hypothetical protein  26.69 
 
 		 536 aa  76.6  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1033  protein of unknown function DUF187  23.91 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419258  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1769  hypothetical protein  25.06 
 
 		 760 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2522  hypothetical protein  24.07 
 
 		 420 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3586  hypothetical protein  24.23 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169957  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0336  hypothetical protein  23.87 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.329121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09991  hypothetical protein  26.23 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.573849 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1911  protein of unknown function DUF187  24.88 
 
 		 427 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0579  hypothetical protein  26.03 
 
 		 501 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1578  hypothetical protein  29.25 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1934  protein of unknown function DUF187  23.57 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4403  protein of unknown function DUF187  22.99 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  0.600099 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>