61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0453 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0453  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  849    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.281099 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0779  hypothetical protein  32.74 
 
 
378 aa  176  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1097  hypothetical protein  34.25 
 
 
426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122525  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1241  membrane protein-like protein  34.31 
 
 
428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0183  membrane protein-like protein  32.98 
 
 
471 aa  162  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343877  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2575  hypothetical protein  27.63 
 
 
418 aa  130  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.612396  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1487  hypothetical protein  28.88 
 
 
411 aa  126  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0192315  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0595  membrane protein  27.09 
 
 
425 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0164312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2082  hypothetical protein  25.43 
 
 
448 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0542  membrane protein  24.26 
 
 
441 aa  107  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215324 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1984  membrane protein  26.93 
 
 
420 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192525  normal  0.0203513 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1783  hypothetical protein  25.94 
 
 
420 aa  106  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00695684  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2103  membrane protein  25.99 
 
 
437 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1972  MgtC/SapB transporter  23.64 
 
 
418 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.315083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0559  hypothetical protein  24.93 
 
 
420 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1067  hypothetical protein  25.75 
 
 
420 aa  104  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1587  hypothetical protein  21.86 
 
 
418 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2904  hypothetical protein  24.93 
 
 
420 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157069  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1182  membrane protein-like  23.51 
 
 
433 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2132  hypothetical protein  26.04 
 
 
423 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.524155  decreased coverage  0.0000326066 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2513  membrane protein  27.02 
 
 
424 aa  100  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196056  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1155  MgtC/SapB transporter  26.85 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0813  hypothetical protein  25.97 
 
 
426 aa  95.5  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002966  hypothetical protein  23.93 
 
 
425 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1183  membrane protein-like protein  26.2 
 
 
433 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.647049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0047  hypothetical protein  25.87 
 
 
417 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1979  membrane protein  27.7 
 
 
418 aa  90.9  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192986  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2707  membrane protein-like protein  23.21 
 
 
426 aa  90.5  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0954887  normal  0.849841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2305  hypothetical protein  27.75 
 
 
427 aa  90.5  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0242022  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1901  membrane protein  25.1 
 
 
413 aa  89.7  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2212  membrane protein  28.83 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.469144  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2187  membrane protein-like protein  22.02 
 
 
426 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.946223  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00550  hypothetical protein  26.32 
 
 
469 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0250309  normal  0.0752819 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1479  membrane protein-like protein  23.64 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0309813  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0897  MgtC/SapB transporter  24.86 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3027  hypothetical protein  24.11 
 
 
452 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.678379  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0333  magnesium transporter accessory protein  27.56 
 
 
437 aa  81.3  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.806096  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0808  hypothetical protein  26.21 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.810338  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5131  hypothetical protein  25.34 
 
 
417 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285021  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4750  hypothetical protein  22.67 
 
 
416 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237655  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6201  hypothetical protein  24.23 
 
 
236 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0922  MgtC family protein  24.08 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500077  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4823  membrane protein  22.81 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2073  hypothetical protein  26.47 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0254302  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1799  putative transmembrane protein  24.44 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.37939  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1865  putative transmembrane protein  24.44 
 
 
417 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0998873  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1818  putative transmembrane protein  24.44 
 
 
417 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3227  hypothetical protein  26.85 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0623753  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35240  hypothetical protein  24.09 
 
 
419 aa  67  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000669836  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2472  membrane protein-like protein  24.27 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595236  normal  0.992981 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2978  MgtC/SapB transporter  23.19 
 
 
439 aa  60.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2260  hypothetical protein  22.61 
 
 
418 aa  60.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3343  transmembrane protein  22.65 
 
 
416 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4934  magnesium transporter accessory protein  21.75 
 
 
428 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.936542  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0922  putative transmembrane protein  23.74 
 
 
403 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.546528  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1692  hypothetical protein  22.71 
 
 
439 aa  53.5  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1172  putative transmembrane protein  27.27 
 
 
414 aa  53.1  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0696977 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2208  magnesium transporter accessory protein  22.25 
 
 
422 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3663  hypothetical protein  26.61 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0504521  hitchhiker  0.0000127877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1126  hypothetical protein  24.02 
 
 
429 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2446  hypothetical protein  24.14 
 
 
416 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385923  normal  0.422644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>