More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0398 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0398  recF protein  100 
 
 		 364 aa  744    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  40.87 
 
 		 367 aa  294  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  40.72 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  40.88 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  38.95 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3886  DNA replication and repair protein RecF  40.66 
 
 		 365 aa  262  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  37.87 
 
 		 368 aa  256  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5456  DNA replication and repair protein RecF  35.93 
 
 		 360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  36.14 
 
 		 377 aa  235  9e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  36.12 
 
 		 370 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  32.1 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  32.72 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.29 
 
 		 363 aa  185  9e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.59 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  31.38 
 
 		 375 aa  177  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.6 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.58 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  30.59 
 
 		 374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  30.05 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  29.18 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  29.18 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  29.91 
 
 		 369 aa  171  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  26.78 
 
 		 361 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  26.78 
 
 		 361 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  30.05 
 
 		 366 aa  169  9e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.11 
 
 		 371 aa  169  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  30.66 
 
 		 373 aa  169  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  30.34 
 
 		 375 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.99 
 
 		 363 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  28.86 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  29.52 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  29.52 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  29.26 
 
 		 375 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  29.26 
 
 		 375 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  29.26 
 
 		 375 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  29.26 
 
 		 375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  29.26 
 
 		 375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  29.26 
 
 		 375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  29.52 
 
 		 372 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  30.86 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  30.85 
 
 		 374 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.22 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  30.61 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  28.84 
 
 		 371 aa  163  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  29.72 
 
 		 402 aa  162  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.23 
 
 		 379 aa  162  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.84 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  29.19 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  30.9 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  28.19 
 
 		 374 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  28.76 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  31.38 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  30.71 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.81 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  30.38 
 
 		 370 aa  156  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.35 
 
 		 377 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  30.51 
 
 		 377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  30.05 
 
 		 401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  30.97 
 
 		 371 aa  156  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  26.2 
 
 		 364 aa  155  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.19 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0749386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  28.86 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.11 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  30.19 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.29 
 
 		 376 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0003  RecF protein  30.59 
 
 		 364 aa  150  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.056932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.07 
 
 		 369 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  27.99 
 
 		 390 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.02 
 
 		 398 aa  145  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.87 
 
 		 386 aa  145  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.78 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  28.12 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  28.25 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.15 
 
 		 397 aa  143  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  28.11 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.46 
 
 		 382 aa  143  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1434  recombinational DNA repair ATPase  29.65 
 
 		 395 aa  143  6e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  29.78 
 
 		 377 aa  142  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  26.77 
 
 		 371 aa  142  9e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  26.27 
 
 		 386 aa  142  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.29 
 
 		 415 aa  141  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  27.04 
 
 		 414 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.82 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  28.86 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.93 
 
 		 359 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  28.37 
 
 		 376 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  0.0000000175389 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  27.62 
 
 		 414 aa  139  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  25.47 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0940  DNA replication and repair protein RecF  28.07 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.86 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0004  recombination protein F  26.68 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  26.3 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  26.3 
 
 		 380 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.5 
 
 		 399 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0004  DNA replication and repair protein RecF  28 
 
 		 373 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  26.3 
 
 		 380 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.3 
 
 		 372 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.9 
 
 		 391 aa  136  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0003  recombination protein F  27.32 
 
 		 361 aa  136  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  28.15 
 
 		 401 aa  136  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>