More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0378 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0378  elongation factor Ts  100 
 
 		 274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  46.93 
 
 		 276 aa  256  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  48.55 
 
 		 277 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  47.67 
 
 		 278 aa  255  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  49.1 
 
 		 277 aa  252  6e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  46.55 
 
 		 279 aa  243  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  46.93 
 
 		 278 aa  237  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  43.91 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  38.95 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  37.89 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  39.03 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  38.46 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  38.6 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  38.91 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  38.49 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  37.89 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  38.25 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  39.07 
 
 		 267 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  37.23 
 
 		 276 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  38.77 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0724  translation elongation factor Ts  35.4 
 
 		 320 aa  177  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  38.85 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1609  translation elongation factor Ts  35.29 
 
 		 320 aa  176  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00132099  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  37.76 
 
 		 288 aa  175  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  37.54 
 
 		 288 aa  175  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  37.67 
 
 		 287 aa  175  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  40.07 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  34.86 
 
 		 288 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  36.77 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  36.92 
 
 		 296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04070  elongation factor Ts  32.3 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  37.12 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  39.05 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  34.84 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  38.41 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  37.36 
 
 		 277 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  38.6 
 
 		 294 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  38.38 
 
 		 286 aa  168  8e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  36.46 
 
 		 294 aa  168  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  37.59 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  37.59 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  38.68 
 
 		 310 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  36.4 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  36.96 
 
 		 271 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  38.11 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  38.89 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  35.64 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  37.59 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  35.53 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  38.89 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  38.11 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  38.89 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  37.59 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  36.4 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  37.59 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  36.46 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  37.87 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  34.93 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  38.52 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  38.52 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  37.23 
 
 		 295 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  37.23 
 
 		 295 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  37.23 
 
 		 295 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  37.23 
 
 		 295 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  37.23 
 
 		 295 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  37.87 
 
 		 294 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  36.55 
 
 		 312 aa  165  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  37.64 
 
 		 292 aa  165  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  36.16 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  37.36 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  39.5 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  39.5 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  37.27 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  36.62 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  38.58 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  35.64 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  37.91 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  37.04 
 
 		 293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  39.85 
 
 		 291 aa  161  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  36.5 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1743  elongation factor Ts  39.86 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  36.67 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  36.14 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  37.18 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  36.3 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  36.61 
 
 		 293 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  37.01 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  36.61 
 
 		 293 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  36.61 
 
 		 293 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  36.61 
 
 		 293 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0706  translation elongation factor Ts  39.65 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000134038  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  36.61 
 
 		 293 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  36.61 
 
 		 293 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  36.61 
 
 		 294 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2177  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00688857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  35.51 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2734  translation elongation factor Ts  35.52 
 
 		 284 aa  158  8e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450458  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  36.03 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>