More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0376 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0376  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 128 aa  252  1.0000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 		 128 aa  167  5e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  58.59 
 
 		 128 aa  165  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 		 128 aa  154  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  57.03 
 
 		 128 aa  154  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  56.25 
 
 		 128 aa  153  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  56.25 
 
 		 128 aa  153  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  57.81 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0881  ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 133 aa  138  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  55.28 
 
 		 170 aa  130  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  52.38 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  48.82 
 
 		 129 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  49.19 
 
 		 162 aa  128  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4467  ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1148  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.542588  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1131  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1158  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 180 aa  127  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 161 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  48.44 
 
 		 128 aa  126  8.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  52.03 
 
 		 132 aa  126  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0626  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0605  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2876  ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0513337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  47.24 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  47.97 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  48.82 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  47.97 
 
 		 158 aa  124  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  47.97 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  51.61 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  47.66 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  47.2 
 
 		 174 aa  124  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 131 aa  124  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  48.82 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0722  ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4052  30S ribosomal protein S9  48.03 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.809908  normal  0.564948 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  48.03 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  47.15 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  47.15 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 162 aa  120  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0650  SSU ribosomal protein S9P  49.61 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.4124e-16  normal  0.0939463 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  47.97 
 
 		 164 aa  120  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2639  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  46.46 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  47.24 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  44.88 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  48.78 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  46.34 
 
 		 160 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3451  30S ribosomal protein S9  46.46 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0078135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  48.78 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 135 aa  120  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  48.46 
 
 		 132 aa  120  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>