More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0375 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0375  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 151 aa  317  3.9999999999999996e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.958432 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  70.86 
 
 		 151 aa  228  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1612  50S ribosomal protein L13  63.58 
 
 		 151 aa  213  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0318086  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  63.95 
 
 		 150 aa  211  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 147 aa  204  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  59.18 
 
 		 147 aa  201  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04085  50S ribosomal protein L13  60.67 
 
 		 151 aa  197  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0052  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 147 aa  193  7e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0880  ribosomal protein L13  59.31 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 143 aa  169  9e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  52.74 
 
 		 149 aa  169  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 143 aa  164  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 143 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 143 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1669  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000843127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 163 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  53.74 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  52.38 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  51.7 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  47.68 
 
 		 159 aa  161  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  50.7 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  50.7 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  50.7 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  50.68 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  49.32 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 144 aa  160  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  50.7 
 
 		 142 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  51.37 
 
 		 153 aa  159  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  50.7 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  50.7 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  46.62 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1019  50S ribosomal protein L13  48.65 
 
 		 156 aa  158  2e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 143 aa  158  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0822  50S ribosomal protein L13  47.3 
 
 		 156 aa  157  4e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.865147  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 143 aa  157  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0330  ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  51.03 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2619  50S ribosomal protein L13  51.7 
 
 		 153 aa  157  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2842  50S ribosomal protein L13  51.7 
 
 		 153 aa  157  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2649  50S ribosomal protein L13  51.7 
 
 		 153 aa  157  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  48.63 
 
 		 147 aa  157  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 145 aa  156  8e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  156  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  50.7 
 
 		 145 aa  155  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  50.68 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  50.68 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  50.68 
 
 		 153 aa  155  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  48.61 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  50.7 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3106  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  48.63 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2707  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613136  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  48.59 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  50.7 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  50.7 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  50.7 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4027  ribosomal protein L13  50 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.240454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2671  50S ribosomal protein L13  49.32 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.133439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  48.59 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 144 aa  154  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  50.7 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 145 aa  153  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  49.3 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  47.95 
 
 		 149 aa  154  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1514  50S ribosomal protein L13  49.66 
 
 		 154 aa  153  7e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.8697  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  48.59 
 
 		 142 aa  153  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  50.68 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>