95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0365 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0365  3'-5' exonuclease domain-containing protein  100 
 
 		 188 aa  383  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1964  3'-5' exonuclease  34.97 
 
 		 214 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0888  3'-5' exonuclease  34.88 
 
 		 238 aa  107  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329161  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1912  3'-5' exonuclease  30.81 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254298  normal  0.272354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2737  3'-5' exonuclease  32.54 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2388  3'-5' exonuclease  32.12 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000109184  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0883  3'-5' exonuclease  31.74 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0280341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1014  3'-5' exonuclease  35.98 
 
 		 303 aa  91.7  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2621  3'-5' exonuclease  32.54 
 
 		 198 aa  90.9  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2929  3'-5' exonuclease  32.4 
 
 		 298 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00209751  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3291  3'-5' exonuclease  35.23 
 
 		 315 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000349721  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0976  3'-5' exonuclease  35.37 
 
 		 299 aa  87.8  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0707907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1153  exonuclease, putative  34.76 
 
 		 261 aa  87  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1697  3'-5' exonuclease  34.87 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1066  3'-5' exonuclease  34.09 
 
 		 320 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0869717  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3387  3'-5' exonuclease  35.23 
 
 		 315 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395277  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2827  3'-5' exonuclease  33.14 
 
 		 198 aa  85.5  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0393048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3512  3'-5' exonuclease  34.66 
 
 		 315 aa  84.7  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643646  normal  0.0140367 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1397  3'-5' exonuclease  30.29 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937954  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2470  3'-5' exonuclease  33.11 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.774502  normal  0.494629 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0980  3'-5' exonuclease  36.08 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3433  3'-5' exonuclease  30.99 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27893  predicted protein  29.88 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.70309 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93442  predicted protein  27.88 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  31.37 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24216  predicted protein  24.21 
 
 		 614 aa  54.7  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000105574  normal  0.257182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4830  3'-5' exonuclease  25.17 
 
 		 294 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0991293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  27.38 
 
 		 371 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000115292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  28.14 
 
 		 392 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05310  hypothetical protein  28.67 
 
 		 912 aa  52.4  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  27.95 
 
 		 388 aa  51.6  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2531  ribonuclease D  29.66 
 
 		 384 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1610  3'-5' exonuclease  24.05 
 
 		 383 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.533574  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  29.41 
 
 		 379 aa  49.7  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30755  predicted protein  25.88 
 
 		 497 aa  48.1  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  31.01 
 
 		 377 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  27.16 
 
 		 894 aa  48.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  27.81 
 
 		 377 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  21.82 
 
 		 382 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  27.5 
 
 		 385 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0542  DNA-directed DNA polymerase  26.55 
 
 		 585 aa  47  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481022  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  28.77 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2253  ribonuclease D  33.66 
 
 		 384 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000377901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2176  ribonuclease D  33.66 
 
 		 384 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000267525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2762  ribonuclease D  29.63 
 
 		 358 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  28.07 
 
 		 377 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  30.15 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2385  ribonuclease D  33.66 
 
 		 388 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000005746  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  33.66 
 
 		 367 aa  45.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  27.49 
 
 		 384 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  27.54 
 
 		 392 aa  45.1  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  31.37 
 
 		 393 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  29.29 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  27.38 
 
 		 294 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  32.67 
 
 		 369 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000212189  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1762  ribonuclease D  25.88 
 
 		 367 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000618336  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  32.67 
 
 		 369 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  32.67 
 
 		 369 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  23.35 
 
 		 382 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  32.67 
 
 		 369 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000359973  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  27.55 
 
 		 394 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  28.25 
 
 		 388 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000003136  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  26.79 
 
 		 288 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  27.22 
 
 		 377 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  27.12 
 
 		 382 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1384  ribonuclease D  29.82 
 
 		 375 aa  42.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0737977  normal  0.865883 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  26.9 
 
 		 384 aa  42.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  26.9 
 
 		 384 aa  42  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5140  cell divisionFtsK/SpoIIIE  22.91 
 
 		 648 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.76274e-16 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  26.19 
 
 		 288 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  30.23 
 
 		 371 aa  42  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01762  hypothetical protein  30.23 
 
 		 375 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  27.39 
 
 		 381 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  30.23 
 
 		 375 aa  42  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01774  ribonuclease D  30.23 
 
 		 375 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05001  exosome complex exonuclease Rrp6, putative (Eurofung)  27.12 
 
 		 1297 aa  42  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333756  normal  0.453331 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  30.23 
 
 		 375 aa  41.6  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  30.23 
 
 		 375 aa  42  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  30.23 
 
 		 371 aa  42  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.299724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  26.63 
 
 		 377 aa  42  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  25 
 
 		 392 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  29.82 
 
 		 375 aa  41.6  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05680  3'-5' exonuclease/helicase (Wrn), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04270)  38.18 
 
 		 320 aa  41.6  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.922382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2016  ribonuclease D  27.43 
 
 		 375 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00169692  normal  0.221518 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0736  ribonuclease D  29.59 
 
 		 381 aa  41.6  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0989413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  27.27 
 
 		 392 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2088  ribonuclease D  26.67 
 
 		 362 aa  41.6  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227904  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1563  ribonuclease D  28.68 
 
 		 377 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459041  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  27.43 
 
 		 375 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  28.57 
 
 		 389 aa  41.2  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  27.27 
 
 		 382 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  25.62 
 
 		 385 aa  41.2  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1064  ribonuclease D (rnase d)  25.29 
 
 		 374 aa  41.2  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00409138  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3922  ribonuclease D  28.57 
 
 		 377 aa  40.8  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  27.27 
 
 		 384 aa  41.2  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>