More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0158 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  100 
 
 		 246 aa  506  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  34.5 
 
 		 226 aa  138  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  34.55 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  36.96 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  35.5 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  35.91 
 
 		 236 aa  128  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  35.81 
 
 		 232 aa  122  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  33.48 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  36.94 
 
 		 239 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.17 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  37.6 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 		 264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  33.48 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  29.44 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  34.05 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  32.74 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  32.76 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  35.07 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.22 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  36.56 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.4 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  37.56 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 		 270 aa  105  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  34.5 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  34.63 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  26.64 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  35.37 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  34.15 
 
 		 236 aa  102  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  34.98 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  32.22 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  42.48 
 
 		 267 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  35.06 
 
 		 269 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  34.42 
 
 		 259 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  32.22 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.06 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 		 220 aa  99.4  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  34.51 
 
 		 227 aa  99.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  31.31 
 
 		 219 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 		 271 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  33.76 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0661  phosphoribosyltransferase  35.56 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  30.99 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  31.14 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  31.28 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  32.46 
 
 		 229 aa  95.5  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  38.67 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  27.95 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.7 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  31.44 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  32.65 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  33.51 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 220 aa  93.6  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  35.45 
 
 		 279 aa  92.8  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  27.51 
 
 		 234 aa  92  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  33.82 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  35.03 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4601  competence protein F  33.65 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.63 
 
 		 215 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  28.05 
 
 		 262 aa  89  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  29.74 
 
 		 255 aa  89  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  39.64 
 
 		 226 aa  88.6  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  31.2 
 
 		 245 aa  88.6  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  29.05 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  29.83 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  26.98 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  33.49 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  31.14 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  46.61 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  36.6 
 
 		 215 aa  87  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.07 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  32.44 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  29 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  31.31 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  33.19 
 
 		 244 aa  85.9  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2857  phosphoribosyltransferase  33.84 
 
 		 274 aa  85.5  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  38.52 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 237 aa  85.1  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  27.71 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  29.1 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  35 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0243  competence protein ComF  39.42 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  30.19 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  37.25 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>