More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0129 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  100 
 
 
374 aa  768    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  45.07 
 
 
378 aa  346  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  41.55 
 
 
378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  43.72 
 
 
376 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  42.25 
 
 
372 aa  302  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  44.89 
 
 
376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  42.97 
 
 
372 aa  278  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 
366 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  35.07 
 
 
428 aa  166  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
386 aa  165  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  37.21 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
370 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
393 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
400 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 
371 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
374 aa  155  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
371 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
374 aa  155  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
408 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
381 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
380 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 
375 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
395 aa  145  9e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
370 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
380 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
372 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
394 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  29.66 
 
 
372 aa  144  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
366 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  29.66 
 
 
372 aa  143  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 
380 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  36.39 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
377 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
385 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
376 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
371 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 
535 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  30.07 
 
 
374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  34.24 
 
 
382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
442 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
382 aa  132  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  27.71 
 
 
430 aa  129  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
387 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  23.31 
 
 
375 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
387 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 
382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  31.37 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.08 
 
 
361 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
435 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  32.36 
 
 
373 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 
375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 
390 aa  126  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  22.76 
 
 
375 aa  126  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  34.54 
 
 
394 aa  126  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
398 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
443 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
373 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  33.08 
 
 
346 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 
346 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  31.12 
 
 
381 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
381 aa  124  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
370 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
434 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
395 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
389 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  29.04 
 
 
351 aa  123  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
378 aa  123  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  29.47 
 
 
353 aa  122  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
383 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  32.44 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
524 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 
377 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 
423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
381 aa  119  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 
371 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
374 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
364 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  28.94 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  28.08 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1813  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
413 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
360 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>