183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0110 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0110  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
346 aa  707  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.84936e-06 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2339  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
347 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5391  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.81 
 
 
345 aa  120  4e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
383 aa  63.2  6e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
409 aa  61.2  3e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13821  hypothetical protein  29.94 
 
 
442 aa  58.9  1e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2483  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
399 aa  57.8  3e-07  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0486018 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 
413 aa  56.2  9e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  23.96 
 
 
374 aa  55.8  1e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 
447 aa  55.5  2e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1131  glycosyl transferase group 1  22.64 
 
 
357 aa  55.1  2e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 
812 aa  54.7  2e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  26.43 
 
 
393 aa  54.7  2e-06  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
410 aa  53.9  4e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5853  putative glycosyl transferase  24.38 
 
 
410 aa  53.5  6e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0350572  normal  0.772659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 
398 aa  53.5  6e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3025  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
389 aa  53.1  7e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.71 
 
 
427 aa  52  1e-05  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
401 aa  52  1e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 
413 aa  51.6  2e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 
369 aa  51.6  2e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1957  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.75 
 
 
366 aa  52  2e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
417 aa  52  2e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2498  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.53 
 
 
398 aa  51.2  2e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0643  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.53 
 
 
398 aa  51.2  2e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0628  glycosyltransferase  25.53 
 
 
398 aa  51.2  2e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2208  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.53 
 
 
398 aa  51.2  2e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.274165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2876  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.53 
 
 
398 aa  51.2  2e-05  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0028  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.53 
 
 
398 aa  51.2  2e-05  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.98 
 
 
373 aa  51.6  2e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  26.34 
 
 
389 aa  51.6  2e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
378 aa  51.6  2e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0807  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.53 
 
 
398 aa  51.2  2e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.64262  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  22.58 
 
 
404 aa  50.8  3e-05  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
339 aa  50.4  4e-05  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 
665 aa  50.1  5e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2417  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
373 aa  50.1  5e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  23.3 
 
 
413 aa  50.4  5e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0384  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
392 aa  50.4  5e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42467  predicted protein  22.3 
 
 
679 aa  50.1  6e-05  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
390 aa  49.7  7e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
505 aa  49.7  8e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
369 aa  49.3  9e-05  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 
820 aa  49.3  9e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  23.79 
 
 
370 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
364 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
819 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  22.28 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  22.29 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  3.47461e-08 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3253  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0227534  normal  0.148006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
518 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  22.39 
 
 
455 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  23.19 
 
 
394 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 
410 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
404 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.32 
 
 
380 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0021  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
507 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0958186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  20.72 
 
 
406 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.86 
 
 
380 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  21.13 
 
 
402 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
362 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  22.45 
 
 
756 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0521  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.91 
 
 
398 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  23.62 
 
 
371 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.86 
 
 
380 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
372 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2562  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.29 
 
 
578 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
390 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  20.72 
 
 
406 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  24.84 
 
 
383 aa  46.6  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
389 aa  46.6  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  20.72 
 
 
406 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  20.72 
 
 
406 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  20.72 
 
 
406 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  20.72 
 
 
406 aa  46.6  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  21.43 
 
 
404 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 
362 aa  46.6  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
369 aa  46.6  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1588  glycosyltransferase  22.76 
 
 
347 aa  46.2  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  24.55 
 
 
452 aa  46.2  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
445 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
389 aa  46.2  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.65 
 
 
380 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0659  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  25.33 
 
 
372 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  7.45959e-07 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3128  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
437 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  23.21 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
510 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  22.81 
 
 
378 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  24.34 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  20.27 
 
 
406 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  22.75 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 
374 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  23.65 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
381 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
372 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03941  putative glycosyl transferase, group 1  23.47 
 
 
421 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>