More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0106 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0106  glycosyl transferase, group 4 family protein  100 
 
 
378 aa  749  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.72417e-06 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0390  glycosyl transferase family 4  33.95 
 
 
384 aa  173  4e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0358308 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0167  glycosyltransferase/acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase  33.99 
 
 
353 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0422469  normal  0.109952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2593  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.25 
 
 
405 aa  141  2e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268685 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  31.68 
 
 
380 aa  140  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.28029e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3910  glycosyl transferase family 4  33.92 
 
 
367 aa  136  7e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  0.993379 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0401  glycosyl transferase family 4  33.9 
 
 
379 aa  134  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1974  glycosyl transferase family 4  31.49 
 
 
393 aa  133  4e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1489  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  31.44 
 
 
551 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.48779e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2133  ATPase  27.75 
 
 
351 aa  130  5e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085223  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1769  glycosyl transferase family 4  32.59 
 
 
394 aa  129  8e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0297431  normal  0.100208 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1319  putative UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  32.73 
 
 
329 aa  127  2e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0207184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 
542 aa  127  4e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  30.67 
 
 
312 aa  126  8e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3046  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  33.58 
 
 
600 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.014062  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0644  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
369 aa  123  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.666126  normal  0.192967 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1417  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  32.3 
 
 
347 aa  122  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11329  undecapaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase rfe  28.61 
 
 
404 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  30.6 
 
 
360 aa  122  1e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0525  Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  30.49 
 
 
406 aa  120  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  3.46321e-05  unclonable  4.70096e-08 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3870  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
399 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0269562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3884  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
399 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.079088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3958  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
399 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
355 aa  120  4e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4336  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
405 aa  120  5e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
380 aa  119  8e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  1.9692e-06  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
357 aa  119  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  30.91 
 
 
357 aa  118  1e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.91 
 
 
357 aa  118  1e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.05483e-08 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.91 
 
 
357 aa  118  1e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
357 aa  119  1e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.91 
 
 
357 aa  118  1e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.44 
 
 
353 aa  118  2e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.37 
 
 
357 aa  118  2e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0795  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  33.43 
 
 
377 aa  118  2e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
357 aa  118  2e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1905  glycosyl transferase family 4  31.53 
 
 
399 aa  118  2e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  32.06 
 
 
357 aa  117  4e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00705  hypothetical protein  30.06 
 
 
360 aa  117  4e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  32.06 
 
 
357 aa  117  4e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.3302e-10 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2580  glycosyl transferase family 4  35.25 
 
 
554 aa  116  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
351 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
351 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  30.12 
 
 
366 aa  115  1e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  3.68413e-06  hitchhiker  4.636e-06 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2661  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
372 aa  115  1e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.705684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1331  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  31.09 
 
 
357 aa  115  2e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000372635 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1396  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  30.5 
 
 
357 aa  114  2e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0774895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1397  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  30.12 
 
 
353 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1332  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  30.12 
 
 
353 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.157987  decreased coverage  0.000128778 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 
349 aa  113  4e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0281  glycosyltransferase  30.06 
 
 
357 aa  113  7e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09950  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.12 
 
 
375 aa  112  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3144  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  27.97 
 
 
366 aa  112  1e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314399  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0327  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  27.11 
 
 
387 aa  111  2e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188042 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2825  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  28.26 
 
 
359 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1416  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  25.62 
 
 
355 aa  110  4e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070531 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
376 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  32.34 
 
 
359 aa  110  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0017  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
333 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233702 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1295  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  30.86 
 
 
359 aa  109  7e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2161  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
591 aa  109  8e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296947 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3031  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  28.87 
 
 
350 aa  109  8e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111205  normal  0.0113432 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  29.28 
 
 
354 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2456  glycosyl transferase family 4  24.93 
 
 
399 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  29.6 
 
 
762 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0428  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase, putative  27.69 
 
 
375 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.316309  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1209  glycosyl transferase family 4  27.48 
 
 
449 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
361 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  7.98419e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2310  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
405 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.440148 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0808  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
360 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.326327  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0249  glycosyl transferase family 4  31.75 
 
 
396 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  33 
 
 
491 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1782  glycosyl transferase family 4  32.13 
 
 
382 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.219636  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  32.33 
 
 
326 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3794  glycosyl transferase family 4  28.19 
 
 
365 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1602  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  29.57 
 
 
345 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  8.60961e-06  normal  0.0685919 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  30.1 
 
 
354 aa  106  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1975  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.12 
 
 
441 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2824  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  32.32 
 
 
357 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
371 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  7.90838e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
495 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1662  glycosyltransferase  26.84 
 
 
425 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4524  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 
336 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183684  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
545 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001775  undecaprenyl-phosphate N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  27.75 
 
 
376 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4145  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  28.07 
 
 
416 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14670  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  27.12 
 
 
391 aa  103  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872844  decreased coverage  3.74023e-07 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1261  glycosyl transferase family 4  29.6 
 
 
394 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.644979  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  27.94 
 
 
321 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  27.24 
 
 
351 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3765  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
360 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00610476  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3206  family 4 glycosyl transferase  29.39 
 
 
360 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2416  putative teichoic acid linkage unit synthesis (synthesis of undecaprenylpyrophosphate-N-aetylglucosamine )  29.25 
 
 
387 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2895  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  28.52 
 
 
349 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1677  glycosyl transferase family 4  26.57 
 
 
349 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1886  glycosyl transferase, group 4 family protein  26.06 
 
 
319 aa  99.8  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1754  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
394 aa  99.8  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2077  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 
348 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212955  hitchhiker  0.00061556 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1605  putative teichoic acid linkage unit synthesis protein  26.06 
 
 
319 aa  99.8  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000246024  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0075  glycosyl transferase family 4  26.06 
 
 
364 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>