More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0104 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  100 
 
 		 675 aa  1399    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  55.07 
 
 		 712 aa  743    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  55.22 
 
 		 719 aa  749    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  57.02 
 
 		 707 aa  745    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  52.67 
 
 		 768 aa  724    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  39.77 
 
 		 701 aa  468  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  39.73 
 
 		 799 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  39.19 
 
 		 686 aa  448  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  40 
 
 		 721 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  40.09 
 
 		 867 aa  433  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  38.4 
 
 		 695 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  40.96 
 
 		 608 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  38.46 
 
 		 754 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  36.57 
 
 		 718 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  37.15 
 
 		 722 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  35.4 
 
 		 729 aa  405  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  38.13 
 
 		 620 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  36.71 
 
 		 891 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  36.56 
 
 		 896 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  36.89 
 
 		 744 aa  395  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  36.07 
 
 		 877 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  36.92 
 
 		 939 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  36.36 
 
 		 854 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  35.99 
 
 		 889 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  34.44 
 
 		 729 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  35.5 
 
 		 1002 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  35.19 
 
 		 714 aa  389  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3176  DNA topoisomerase III  36.13 
 
 		 873 aa  389  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  34.15 
 
 		 729 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  35.79 
 
 		 908 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  34.95 
 
 		 876 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  36.8 
 
 		 846 aa  385  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  35.99 
 
 		 888 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  35.43 
 
 		 920 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  33.86 
 
 		 729 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  33.86 
 
 		 729 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  33.86 
 
 		 729 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  33.86 
 
 		 729 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  34.95 
 
 		 876 aa  382  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  35.57 
 
 		 865 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  33.86 
 
 		 729 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  33.72 
 
 		 731 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  33.72 
 
 		 729 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  35.57 
 
 		 865 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  33.86 
 
 		 729 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  34.8 
 
 		 730 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  34.72 
 
 		 982 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  35.81 
 
 		 865 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1984  DNA topoisomerase III  35.04 
 
 		 714 aa  379  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1767  DNA topoisomerase III  35.28 
 
 		 714 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.258845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  36.43 
 
 		 869 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1744  DNA topoisomerase III  35.28 
 
 		 714 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.129964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  36.43 
 
 		 869 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  36.43 
 
 		 869 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  36.43 
 
 		 869 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  35.28 
 
 		 876 aa  379  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1905  DNA topoisomerase III  35.28 
 
 		 714 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000492134  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  36.43 
 
 		 869 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  35.95 
 
 		 891 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3433  DNA topoisomerase III  35.28 
 
 		 714 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000032124  hitchhiker  0.00000000499159 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  35.81 
 
 		 865 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  36.43 
 
 		 869 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  33.86 
 
 		 729 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  35.52 
 
 		 865 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2011  DNA topoisomerase III  35.28 
 
 		 714 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00587828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  35.81 
 
 		 865 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  33.72 
 
 		 729 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1911  DNA topoisomerase III  35.28 
 
 		 714 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129988  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  33.95 
 
 		 980 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  36.43 
 
 		 906 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1725  DNA topoisomerase III  35.14 
 
 		 714 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0147593  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  35.81 
 
 		 865 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1940  DNA topoisomerase III  35.14 
 
 		 714 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08242e-41 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1472  DNA topoisomerase III  37.95 
 
 		 714 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000939771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  33.66 
 
 		 992 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  33.72 
 
 		 731 aa  375  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  34.63 
 
 		 981 aa  375  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1822  DNA topoisomerase type IA central domain protein  35.99 
 
 		 573 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3236  DNA topoisomerase  35.46 
 
 		 777 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  34.53 
 
 		 975 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  33.76 
 
 		 990 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  34.63 
 
 		 981 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_002950  PG1495  DNA topoisomerase III  35.33 
 
 		 697 aa  367  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0210844 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0072  DNA topoisomerase  31.38 
 
 		 720 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  35.29 
 
 		 839 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3021  DNA topoisomerase  37.05 
 
 		 689 aa  365  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1657  DNA topoisomerase III  37.58 
 
 		 666 aa  364  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5409  DNA topoisomerase III  31.81 
 
 		 714 aa  363  6e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  36.31 
 
 		 697 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0401  DNA topoisomerase  35.04 
 
 		 851 aa  360  4e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0152197  decreased coverage  0.0000578583 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  33.24 
 
 		 879 aa  360  7e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3177  DNA topoisomerase III  33.47 
 
 		 920 aa  355  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1814  DNA topoisomerase III  33.24 
 
 		 746 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000049095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  34.93 
 
 		 670 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2145  DNA topoisomerase III  35.89 
 
 		 694 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.393649  normal  0.847419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1445  DNA topoisomerase III  35.8 
 
 		 670 aa  353  5e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1612  DNA topoisomerase III  35.6 
 
 		 680 aa  353  7e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2281  DNA topoisomerase III  33.53 
 
 		 711 aa  352  8.999999999999999e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00290966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2322  DNA topoisomerase III  33.53 
 
 		 711 aa  352  8.999999999999999e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0191867  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1311  DNA topoisomerase III  35.65 
 
 		 670 aa  352  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617817  normal  0.472468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>