More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0093 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  100 
 
 
331 aa  667  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  44.62 
 
 
326 aa  266  4e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0477  hypothetical protein  43.64 
 
 
332 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0396  secretion protein HlyD family protein  44.65 
 
 
330 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  44.03 
 
 
326 aa  244  2e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  42.63 
 
 
322 aa  233  2e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  41.25 
 
 
324 aa  231  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0604  secretion protein HlyD family protein  43.25 
 
 
326 aa  230  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3729  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 
329 aa  229  6e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  40.62 
 
 
324 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  40.31 
 
 
324 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  40.31 
 
 
324 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  40.31 
 
 
324 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4393  secretion protein HlyD family protein  42.23 
 
 
323 aa  225  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0150137  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  40.75 
 
 
324 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  40.75 
 
 
324 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  40.44 
 
 
324 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  40.56 
 
 
324 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3745  secretion protein HlyD family protein  41.32 
 
 
323 aa  221  1e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  40.13 
 
 
323 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0567  secretion protein HlyD family protein  40.75 
 
 
323 aa  215  9e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.142155 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1212  hypothetical protein  42.63 
 
 
324 aa  215  1e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000214097  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02435  hypothetical protein  43.12 
 
 
326 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0618  putative secretion protein, HlyD family  44.41 
 
 
326 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  40.62 
 
 
323 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  40.62 
 
 
323 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1840  hypothetical protein  37.69 
 
 
332 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.137202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  40.62 
 
 
323 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  37.58 
 
 
357 aa  190  3e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  34.41 
 
 
427 aa  185  9e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4571  secretion protein HlyD family protein  39.93 
 
 
349 aa  182  5e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707913  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1173  secretion protein HlyD family protein  41.55 
 
 
337 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  35.97 
 
 
330 aa  175  1e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2703  secretion protein HlyD family protein  33.54 
 
 
367 aa  169  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  31.75 
 
 
323 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  31.75 
 
 
323 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  30.16 
 
 
323 aa  152  9e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  28.21 
 
 
328 aa  141  2e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  31.21 
 
 
353 aa  129  8e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2701  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 
333 aa  128  2e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  27.3 
 
 
398 aa  109  7e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  27.36 
 
 
334 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  27.39 
 
 
329 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  27.42 
 
 
335 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  28.01 
 
 
342 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  25.93 
 
 
355 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  25.93 
 
 
355 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  25.93 
 
 
355 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  25.93 
 
 
355 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  25.93 
 
 
355 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  26.54 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  25.62 
 
 
355 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  26.33 
 
 
332 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  26.73 
 
 
335 aa  92.8  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 
333 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  28.92 
 
 
333 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  27.55 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  26.69 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.37701e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  27.42 
 
 
354 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  27.12 
 
 
331 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  27.12 
 
 
331 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  26.09 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  27.12 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  25.76 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  27.12 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  25.43 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  27.12 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  28.98 
 
 
382 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  26.65 
 
 
326 aa  86.7  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  28.27 
 
 
357 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  25.72 
 
 
355 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  25.72 
 
 
355 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  25.72 
 
 
355 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  25.51 
 
 
354 aa  86.7  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  27.46 
 
 
334 aa  86.3  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  25.72 
 
 
355 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  26.74 
 
 
329 aa  85.9  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.81 
 
 
462 aa  85.9  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  7.55017e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  26.26 
 
 
328 aa  85.1  1e-15  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  27.33 
 
 
467 aa  85.1  2e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  25.62 
 
 
355 aa  83.2  5e-15  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  26.56 
 
 
357 aa  83.2  6e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  27.53 
 
 
357 aa  82.8  7e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  28.99 
 
 
355 aa  82.4  9e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  25.99 
 
 
328 aa  81.3  2e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  27.18 
 
 
358 aa  81.3  2e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  27.24 
 
 
343 aa  80.9  3e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  25.16 
 
 
357 aa  80.5  3e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  26.12 
 
 
359 aa  80.5  3e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  27.12 
 
 
342 aa  80.9  3e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  25.75 
 
 
395 aa  80.5  4e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  26.44 
 
 
331 aa  80.1  5e-14  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  25.15 
 
 
328 aa  80.1  5e-14  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  25.15 
 
 
328 aa  80.1  5e-14  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  30.28 
 
 
352 aa  80.1  5e-14  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  26.09 
 
 
357 aa  79.7  6e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  29.07 
 
 
355 aa  79.7  6e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  26.44 
 
 
331 aa  79.3  7e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  26.44 
 
 
331 aa  79.3  7e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  26.44 
 
 
331 aa  79.7  7e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>