205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0092 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0092  transporter, putative  100 
 
 
379 aa  775  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  26.22 
 
 
383 aa  173  6e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  29.38 
 
 
402 aa  128  1e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  27 
 
 
387 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  24.71 
 
 
395 aa  120  5e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  25.94 
 
 
395 aa  118  2e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 
780 aa  115  8e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  24.86 
 
 
378 aa  114  2e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  25.41 
 
 
362 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  25.67 
 
 
387 aa  106  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  27.27 
 
 
375 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  27.33 
 
 
435 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 
390 aa  103  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 
387 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 
389 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  24.55 
 
 
372 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 
405 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  25.65 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  26.46 
 
 
390 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  26.35 
 
 
430 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  25.92 
 
 
429 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  26.12 
 
 
390 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  25 
 
 
371 aa  89.4  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  25.65 
 
 
429 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  21.95 
 
 
379 aa  85.5  1e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  23.8 
 
 
390 aa  85.1  2e-15  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 
405 aa  84.3  3e-15  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 
430 aa  82.8  9e-15  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 
395 aa  80.9  3e-14  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 
391 aa  80.1  6e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  21.85 
 
 
391 aa  79  1e-13  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 
376 aa  78.6  2e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  21.36 
 
 
383 aa  77  5e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0500  ABC-2 type transporter  23.37 
 
 
384 aa  77  5e-13  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  24.18 
 
 
382 aa  76.6  6e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 
384 aa  76.6  7e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 
408 aa  75.5  1e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  24.29 
 
 
293 aa  75.1  2e-12  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  22.52 
 
 
365 aa  74.7  2e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.31089e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  25.08 
 
 
395 aa  74.3  3e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 
417 aa  72  2e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 
378 aa  70.9  4e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 
380 aa  70.5  4e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 
380 aa  70.1  6e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  22.05 
 
 
434 aa  69.3  9e-11  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 
381 aa  69.7  9e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  22.73 
 
 
380 aa  69.7  9e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 
382 aa  68.9  1e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  23.06 
 
 
415 aa  68.9  1e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  21.64 
 
 
366 aa  69.3  1e-10  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 
373 aa  68.6  2e-10  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 
383 aa  67.8  3e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 
384 aa  67.8  3e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  25.91 
 
 
378 aa  68.2  3e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  23.92 
 
 
370 aa  67.8  3e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 
390 aa  67.4  4e-10  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  20.63 
 
 
383 aa  66.6  7e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  22.81 
 
 
405 aa  66.2  9e-10  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  23.53 
 
 
373 aa  66.2  9e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  22.71 
 
 
376 aa  65.9  1e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  25.97 
 
 
378 aa  65.5  1e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  21.64 
 
 
380 aa  66.2  1e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  21.39 
 
 
373 aa  64.7  2e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  21.39 
 
 
373 aa  64.7  2e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  25.2 
 
 
383 aa  64.7  2e-09  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  21.39 
 
 
373 aa  64.7  2e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  21.39 
 
 
373 aa  64.7  2e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 
379 aa  64.7  3e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  24.93 
 
 
375 aa  64.7  3e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 
397 aa  64.7  3e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  23.28 
 
 
381 aa  64.7  3e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  24.13 
 
 
376 aa  64.3  3e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  28.21 
 
 
383 aa  64.7  3e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 
383 aa  64.7  3e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  24.18 
 
 
379 aa  63.9  4e-09  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 
381 aa  64.3  4e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 
373 aa  63.9  4e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.91 
 
 
378 aa  63.5  6e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 
392 aa  63.2  7e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 
381 aa  63.2  7e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  22.96 
 
 
378 aa  62.8  9e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  24.71 
 
 
397 aa  62.8  1e-08  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  22.58 
 
 
366 aa  62.4  1e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  22.75 
 
 
378 aa  62  1e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  22.58 
 
 
373 aa  62.4  1e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  22.32 
 
 
380 aa  62.4  1e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  25.21 
 
 
376 aa  61.6  2e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  22.89 
 
 
373 aa  61.6  2e-08  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  20.11 
 
 
376 aa  61.6  2e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 
373 aa  61.2  3e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  26.46 
 
 
386 aa  60.8  3e-08  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  23.48 
 
 
376 aa  60.8  3e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 
373 aa  61.2  3e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  21.34 
 
 
367 aa  60.5  5e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  23.56 
 
 
901 aa  59.7  8e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  21.34 
 
 
371 aa  59.7  8e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  23.43 
 
 
379 aa  59.3  1e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  21.59 
 
 
372 aa  59.3  1e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  25 
 
 
383 aa  59.3  1e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>