More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0090 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0090  Dps family protein  100 
 
 
159 aa  322  1e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0858157 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2688  Ferritin Dps family protein  44.37 
 
 
163 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119326  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2381  DPS family protein  50.39 
 
 
156 aa  140  1e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  45.16 
 
 
161 aa  139  1e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2829  Ferritin Dps family protein  43.87 
 
 
161 aa  139  2e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.901584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3485  Ferritin, Dps family protein  41.89 
 
 
157 aa  137  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001469  non-specific DNA-binding protein Dps/iron-binding ferritin-like antioxidant protein/ferroxidase  46.15 
 
 
159 aa  136  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0131  DNA-binding stress protein  41.5 
 
 
159 aa  136  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  40.79 
 
 
157 aa  132  2e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05408  hypothetical protein  44.87 
 
 
159 aa  131  4e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0379  Ferritin Dps family protein  43.71 
 
 
158 aa  131  4e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2021  DNA-binding protein; DPS family protein  38.71 
 
 
158 aa  128  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1620  putative DNA-binding protein, Dps  35.81 
 
 
161 aa  128  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00952275  normal  0.23564 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  37.84 
 
 
156 aa  127  4e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1852  Ferritin and Dps  37.16 
 
 
161 aa  127  5e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206437  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13178  DPS family protein  41.06 
 
 
163 aa  123  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0327  Ferritin Dps family protein  40.13 
 
 
159 aa  120  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2914  Ferritin Dps family protein  37.5 
 
 
159 aa  117  5e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.319607  hitchhiker  1.75799e-09 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0327  Ferritin Dps family protein  36.84 
 
 
159 aa  117  5e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743454  hitchhiker  0.00750622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4766  Ferritin, Dps family protein  39.23 
 
 
159 aa  111  4e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  35.97 
 
 
146 aa  107  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  35.97 
 
 
146 aa  107  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  38.03 
 
 
146 aa  107  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  35.97 
 
 
146 aa  107  8e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.05724e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  35.97 
 
 
146 aa  107  8e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  35.97 
 
 
146 aa  107  8e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  35.97 
 
 
146 aa  107  8e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  35.97 
 
 
146 aa  107  8e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  35.97 
 
 
146 aa  107  9e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  2.72675e-13 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  35.97 
 
 
146 aa  107  9e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  35.25 
 
 
146 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  3.26402e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  37.41 
 
 
147 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  37.41 
 
 
147 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  37.41 
 
 
147 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  37.41 
 
 
147 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  37.41 
 
 
147 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  38.13 
 
 
147 aa  101  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  37.41 
 
 
147 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  37.41 
 
 
147 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  36.69 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  36.69 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  34.69 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  33.33 
 
 
157 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  33.33 
 
 
157 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  33.11 
 
 
155 aa  97.4  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  35.25 
 
 
147 aa  97.1  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  35.25 
 
 
147 aa  97.1  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  35.88 
 
 
146 aa  97.1  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  34.97 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  33.33 
 
 
156 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  34.33 
 
 
146 aa  94  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  32.67 
 
 
158 aa  94  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  33.1 
 
 
157 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  33.1 
 
 
157 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  35.97 
 
 
147 aa  94  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  33.1 
 
 
157 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1265  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.758544  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  33.1 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  34.69 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  30.61 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  30.61 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  30.67 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  30.61 
 
 
155 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  31.13 
 
 
155 aa  92  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  30.61 
 
 
155 aa  92  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  30.61 
 
 
155 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  30.61 
 
 
158 aa  91.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  32.67 
 
 
162 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  32.67 
 
 
162 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0711  neutrophil activating protein A (napA)  34.84 
 
 
178 aa  91.3  5e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  30.61 
 
 
155 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  30.61 
 
 
155 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 
162 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  31.33 
 
 
165 aa  90.9  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
162 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  33.33 
 
 
162 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  30.67 
 
 
161 aa  90.5  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  30.61 
 
 
155 aa  90.5  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  32 
 
 
162 aa  90.5  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  30.67 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  30.61 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1549  Ferritin Dps family protein  34.48 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297142  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0829  Ferritin Dps family protein  33.09 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2946  Ferritin Dps family protein  34.23 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  31.33 
 
 
179 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  32.67 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  32.67 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  32.67 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  32.67 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4546  DNA-binding stress protein  32.45 
 
 
156 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.632202  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  32.67 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  32.67 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3808  Ferritin Dps family protein  31.47 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  2.907e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51830  DNA-binding stress protein  32.45 
 
 
156 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0248589  hitchhiker  0.0024179 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  32.67 
 
 
162 aa  89  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2598  Dps family protein  33.82 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  4.51482e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  32.67 
 
 
162 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  30.61 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  31.33 
 
 
164 aa  87.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  31.29 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>