More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0087 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0087  SIS domain-containing protein  100 
 
 
206 aa  421  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  44.97 
 
 
320 aa  164  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  44.97 
 
 
320 aa  164  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  46.2 
 
 
327 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  43.62 
 
 
323 aa  159  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.09 
 
 
328 aa  158  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  44.86 
 
 
321 aa  158  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  43.63 
 
 
330 aa  158  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  45.41 
 
 
324 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  45.66 
 
 
322 aa  157  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  46.24 
 
 
323 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  43.48 
 
 
330 aa  156  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  44.86 
 
 
324 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  44.44 
 
 
333 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  43.46 
 
 
326 aa  156  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  44.32 
 
 
324 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  46.7 
 
 
321 aa  155  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  45.03 
 
 
327 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.2 
 
 
328 aa  155  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.34 
 
 
345 aa  155  5e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  44.32 
 
 
324 aa  155  5e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  47.53 
 
 
321 aa  154  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  8.47451e-08 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.09 
 
 
357 aa  154  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  44.86 
 
 
324 aa  154  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  43.78 
 
 
322 aa  154  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.09 
 
 
342 aa  154  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.09 
 
 
328 aa  154  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  44.74 
 
 
327 aa  154  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  45.11 
 
 
322 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  43.68 
 
 
321 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  43.32 
 
 
325 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.51 
 
 
328 aa  152  3e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  39.81 
 
 
363 aa  152  3e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  43.16 
 
 
328 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.16 
 
 
328 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.16 
 
 
328 aa  152  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  47.56 
 
 
339 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  42.49 
 
 
320 aa  152  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  41.45 
 
 
340 aa  152  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  43.16 
 
 
328 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.16 
 
 
328 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.16 
 
 
328 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.16 
 
 
328 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.16 
 
 
328 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  43.68 
 
 
327 aa  151  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  44.86 
 
 
344 aa  151  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  45.79 
 
 
327 aa  151  6e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  42.33 
 
 
329 aa  151  6e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.63 
 
 
328 aa  151  6e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  44.77 
 
 
326 aa  151  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  43.78 
 
 
329 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  44.77 
 
 
324 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.16 
 
 
328 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  43.98 
 
 
330 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  45.26 
 
 
327 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  45.26 
 
 
327 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  45.26 
 
 
327 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3588  arabinose-5-phosphate isomerase  42.27 
 
 
320 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  45.66 
 
 
324 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  45.26 
 
 
327 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  45.26 
 
 
327 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  45.26 
 
 
327 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  45.26 
 
 
327 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.63 
 
 
328 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.63 
 
 
328 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.63 
 
 
328 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  45.71 
 
 
325 aa  149  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.63 
 
 
328 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  44.32 
 
 
324 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.11 
 
 
328 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  47.83 
 
 
345 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0331  KpsF/GutQ family protein  44.74 
 
 
346 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7389  KpsF/GutQ  43.37 
 
 
310 aa  148  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5916  KpsF/GutQ family protein  42.86 
 
 
310 aa  148  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0826034  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  45.26 
 
 
327 aa  148  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3418  KpsF/GutQ  46.32 
 
 
332 aa  148  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.2508e-05  normal  0.585789 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  47.2 
 
 
345 aa  148  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1058  KpsF/GutQ family protein  41.26 
 
 
338 aa  148  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  48.15 
 
 
339 aa  147  8e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  43.89 
 
 
341 aa  147  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2846  KpsF/GutQ family protein  45.26 
 
 
327 aa  147  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4064  KpsF/GutQ family protein  40.1 
 
 
348 aa  147  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3105  KpsF/GutQ family protein  41.45 
 
 
324 aa  147  1e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.345406  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  46.34 
 
 
333 aa  147  1e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  46.34 
 
 
333 aa  147  1e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  43.17 
 
 
321 aa  147  1e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  42.78 
 
 
327 aa  147  1e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  44.21 
 
 
328 aa  147  1e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  42.53 
 
 
318 aa  147  1e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4212  KpsF/GutQ family protein  39.58 
 
 
348 aa  146  2e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  42.7 
 
 
324 aa  146  2e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3030  sugar isomerase, KpsF/GutQ family  43.93 
 
 
328 aa  146  2e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2638  KpsF/GutQ family protein  43.93 
 
 
328 aa  146  2e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545154  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  45.09 
 
 
325 aa  146  2e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  45.71 
 
 
325 aa  147  2e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  41.97 
 
 
325 aa  146  2e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6185  KpsF/GutQ family protein  46.24 
 
 
291 aa  146  2e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  38.66 
 
 
319 aa  146  2e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4187  KpsF/GutQ family protein  39.58 
 
 
348 aa  146  2e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  46.91 
 
 
325 aa  146  2e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.338058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>