53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0085 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  100 
 
 
434 aa  896  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  36.71 
 
 
693 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  37.84 
 
 
541 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  38.74 
 
 
604 aa  208  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  37.95 
 
 
403 aa  201  2e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  37.77 
 
 
407 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  38.34 
 
 
567 aa  197  4e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  33.84 
 
 
387 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  34.15 
 
 
411 aa  186  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  34.53 
 
 
547 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  34.97 
 
 
408 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  34.63 
 
 
408 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  1.5241e-12  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  35.87 
 
 
535 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  33.14 
 
 
399 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  6.54104e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  34.34 
 
 
471 aa  180  6e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  33.33 
 
 
597 aa  174  3e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  33.83 
 
 
568 aa  165  2e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  31.71 
 
 
548 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  32.35 
 
 
558 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  31.92 
 
 
574 aa  154  3e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  34.31 
 
 
850 aa  154  3e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  32.49 
 
 
320 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  30.81 
 
 
413 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  30.41 
 
 
727 aa  142  1e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  26.65 
 
 
658 aa  136  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  27.25 
 
 
535 aa  135  2e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  28.21 
 
 
532 aa  132  1e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  26.13 
 
 
535 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  1.86405e-06 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  26.12 
 
 
533 aa  117  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  23.84 
 
 
677 aa  116  1e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  26.96 
 
 
469 aa  112  1e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  27.55 
 
 
640 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  24.75 
 
 
636 aa  97.8  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  27.27 
 
 
583 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  25.07 
 
 
631 aa  86.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  27.48 
 
 
441 aa  80.9  4e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  25.22 
 
 
612 aa  75.5  2e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.56 
 
 
445 aa  73.6  6e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  24.74 
 
 
450 aa  71.2  4e-11  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  25.59 
 
 
427 aa  68.9  2e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  23.98 
 
 
587 aa  67  6e-10  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  23.56 
 
 
446 aa  63.9  5e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  23.51 
 
 
442 aa  63.2  8e-09  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  20.51 
 
 
433 aa  62.4  1e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  22.48 
 
 
445 aa  61.2  3e-08  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  24.85 
 
 
589 aa  59.7  1e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  20.83 
 
 
453 aa  58.2  3e-07  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  24.72 
 
 
469 aa  56.6  9e-07  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  23.93 
 
 
424 aa  54.3  4e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  22.19 
 
 
440 aa  54.3  4e-06  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  32.58 
 
 
737 aa  53.1  1e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  21.73 
 
 
435 aa  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  2.26064e-06  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  32.86 
 
 
700 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>