19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0078 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0078  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  476  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2149  abortive phage resistance protein  36 
 
 
196 aa  114  2e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.744102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1558  hypothetical protein  28.12 
 
 
224 aa  82.8  4e-15  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420062  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1293  hypothetical protein  29.95 
 
 
194 aa  81.6  1e-14  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.464309  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2209  hypothetical protein  30.45 
 
 
225 aa  79  5e-14  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11633  hypothetical protein  28.03 
 
 
257 aa  73.2  3e-12  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.389497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2063  hypothetical protein  36.84 
 
 
214 aa  71.6  1e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.336699  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7389  hypothetical protein  23.5 
 
 
219 aa  68.2  1e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0790  hypothetical protein  30.87 
 
 
162 aa  67.4  2e-10  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3792  abortive phage resistance protein-like  37.04 
 
 
198 aa  62.8  5e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2869  hypothetical protein  26.78 
 
 
223 aa  60.8  2e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1919  abortive phage resistance protein-like  36.11 
 
 
198 aa  60.1  3e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  3.52931e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0996  CRISPR-associated protein, Csm2 family  29.33 
 
 
220 aa  58.2  1e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.462721  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1042  hypothetical protein  27.59 
 
 
208 aa  51.6  9e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0299  hypothetical protein  26.61 
 
 
221 aa  51.2  1e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153747  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3540  hypothetical protein  26.05 
 
 
211 aa  49.7  4e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4360  hypothetical protein  27.37 
 
 
190 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12610  hypothetical protein  26.29 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1073  abortive phage resistance protein-like protein  26.51 
 
 
217 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>