More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0075 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0075  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase, putative  100 
 
 
413 aa  857  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2353  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  71.13 
 
 
392 aa  592  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604383  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13623  putative phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  71.58 
 
 
393 aa  586  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6522  Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  69.82 
 
 
392 aa  578  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.240405 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1583  Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  68.99 
 
 
390 aa  572  1e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.911808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4180  Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  68.99 
 
 
388 aa  572  1e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0231005  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2978  Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  69.64 
 
 
393 aa  572  1e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0562441  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6005  Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  67.78 
 
 
389 aa  568  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0126  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  70.47 
 
 
393 aa  565  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19257  predicted protein  70.57 
 
 
383 aa  534  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  1.6644e-05  hitchhiker  0.0048219 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17852  predicted protein  70.57 
 
 
383 aa  534  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00377109  normal  0.168751 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0568  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  29.39 
 
 
349 aa  116  7e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0810  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  30.15 
 
 
351 aa  109  9e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.128611  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1419  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  27.19 
 
 
349 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0337  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.61 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.112508  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1156  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  25.36 
 
 
324 aa  98.2  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0500  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.22 
 
 
349 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.927919  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0665  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  29.66 
 
 
332 aa  95.9  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0862  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  24.7 
 
 
333 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2640  Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  26.15 
 
 
367 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1252  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.43 
 
 
332 aa  88.6  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.850982  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3493  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  28.05 
 
 
333 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1979  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  25.07 
 
 
333 aa  85.9  1e-15  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0479133  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1697  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  28.94 
 
 
322 aa  85.9  1e-15  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0582  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  24.69 
 
 
340 aa  85.9  1e-15  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1625  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  27.44 
 
 
330 aa  83.6  6e-15  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  28.09 
 
 
350 aa  83.6  7e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0862  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.49 
 
 
343 aa  83.2  8e-15  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.454531  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0051  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  24.92 
 
 
333 aa  83.2  9e-15  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  27.33 
 
 
339 aa  82.4  1e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0738  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  27.49 
 
 
354 aa  81.3  3e-14  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1977  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  25.69 
 
 
372 aa  81.3  3e-14  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0188023 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  24.4 
 
 
353 aa  80.9  4e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0310  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  26.61 
 
 
346 aa  80.9  4e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  28.4 
 
 
347 aa  80.9  4e-14  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  25.76 
 
 
352 aa  80.5  5e-14  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.224648 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  25.61 
 
 
336 aa  79.3  1e-13  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.07 
 
 
342 aa  79  1e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0075  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  28.43 
 
 
335 aa  79.3  1e-13  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.496128  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1131  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.07 
 
 
342 aa  79  1e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1137  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  25.08 
 
 
346 aa  78.2  2e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  23.66 
 
 
354 aa  79  2e-13  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000206442  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.28 
 
 
350 aa  77.8  3e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2786  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  27.08 
 
 
335 aa  78.2  3e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2702  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.06 
 
 
345 aa  75.9  1e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00227816  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3278  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  24.48 
 
 
348 aa  75.1  2e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1248  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  25.53 
 
 
340 aa  75.1  2e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288462  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1255  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  25.61 
 
 
345 aa  75.5  2e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2746  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  25.38 
 
 
329 aa  74.7  3e-12  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1668  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  24.92 
 
 
350 aa  74.3  3e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269909  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2608  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  25 
 
 
345 aa  73.9  4e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0998  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  27.16 
 
 
341 aa  73.9  4e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0027  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  24.49 
 
 
340 aa  73.6  6e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0407  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  24.74 
 
 
336 aa  73.6  7e-12  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3267  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  27.01 
 
 
351 aa  73.2  7e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1033  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  25.38 
 
 
344 aa  73.2  8e-12  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3055  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  25.68 
 
 
330 aa  72.4  1e-11  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2195  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.69 
 
 
351 aa  71.6  2e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.09 
 
 
344 aa  71.6  2e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000477896 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0399  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  23.68 
 
 
342 aa  72  2e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.862659  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0511  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.69 
 
 
351 aa  71.6  2e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1088  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.69 
 
 
351 aa  71.6  2e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.69 
 
 
351 aa  72  2e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3300  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.69 
 
 
351 aa  71.6  2e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863837  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.69 
 
 
351 aa  71.6  2e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0052  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  25.08 
 
 
339 aa  71.2  3e-11  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1928  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  22.53 
 
 
352 aa  71.2  3e-11  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  25.45 
 
 
346 aa  70.9  4e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  25.39 
 
 
350 aa  70.9  4e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  27.74 
 
 
346 aa  70.9  4e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0265  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  22.53 
 
 
363 aa  70.5  5e-11  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0456  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  24.05 
 
 
360 aa  70.5  5e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1984  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.19 
 
 
323 aa  70.5  6e-11  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0608348  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  27.39 
 
 
351 aa  70.1  7e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0761  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  27.39 
 
 
351 aa  70.1  7e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0277  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  27.39 
 
 
351 aa  70.1  7e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  24.01 
 
 
345 aa  70.1  7e-11  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3213  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  25.47 
 
 
378 aa  69.7  8e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3311  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.37 
 
 
351 aa  69.7  8e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2444  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.38 
 
 
328 aa  70.1  8e-11  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  25.39 
 
 
350 aa  69.7  1e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1777  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  24.46 
 
 
345 aa  68.9  1e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  1.54728e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  27.65 
 
 
348 aa  68.9  1e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.77 
 
 
351 aa  68.6  2e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113914  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1418  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  23.74 
 
 
361 aa  68.6  2e-10  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0333314  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1672  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  24.71 
 
 
351 aa  68.6  2e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103618  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01760  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  25.4 
 
 
351 aa  68.6  2e-10  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0406  Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  25.45 
 
 
370 aa  68.9  2e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.810597  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0400  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  24.84 
 
 
330 aa  67.4  4e-10  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.243821 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  23.99 
 
 
350 aa  67.8  4e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1720  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  24.7 
 
 
368 aa  67.8  4e-10  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  27.33 
 
 
354 aa  67.8  4e-10  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  24.06 
 
 
348 aa  67  5e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1700  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.95 
 
 
329 aa  67.4  5e-10  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  23.44 
 
 
348 aa  67  6e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  25.45 
 
 
345 aa  67  6e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  25.53 
 
 
346 aa  67  6e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3469  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  23.19 
 
 
341 aa  66.6  7e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1033  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  24.92 
 
 
337 aa  66.6  7e-10  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2858  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  26.82 
 
 
351 aa  66.2  9e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.693195  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>