134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0073 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0073  orotidine 5'-monophosphate decarboxylase  100 
 
 
276 aa  573  1e-162  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2966  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  60.95 
 
 
274 aa  340  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1970  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  58.24 
 
 
272 aa  337  2e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2322  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  58.65 
 
 
273 aa  332  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13603  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  57.52 
 
 
274 aa  330  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3069  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  57.5 
 
 
276 aa  317  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.201112  hitchhiker  0.00274028 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2698  orotidine 5' phosphate decarboxylase  56.99 
 
 
274 aa  314  9e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0183887  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2230  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  54.35 
 
 
274 aa  306  2e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.332513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0435  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  58.03 
 
 
279 aa  303  1e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.514449  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0006  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  47.96 
 
 
280 aa  239  4e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0088  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.82 
 
 
279 aa  234  2e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0101  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.21 
 
 
274 aa  232  4e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0124  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.24 
 
 
274 aa  231  9e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.9 
 
 
274 aa  226  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2677  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  50 
 
 
274 aa  221  1e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3450  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.15 
 
 
270 aa  220  2e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.799758  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0079  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  49.79 
 
 
274 aa  212  6e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000192992  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2608  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.48 
 
 
283 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3018  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.48 
 
 
271 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397504 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2773  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.35 
 
 
288 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3050  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.35 
 
 
272 aa  201  1e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2203  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.08 
 
 
266 aa  201  2e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0190  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.56 
 
 
272 aa  199  4e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  3.50723e-06  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4616  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.37 
 
 
285 aa  198  8e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1444  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.67 
 
 
267 aa  197  2e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  5.34867e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2851  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.28 
 
 
302 aa  197  2e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2609  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.8 
 
 
271 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.13 
 
 
271 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0610032  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.97 
 
 
272 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0751763  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0401  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.65 
 
 
275 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.46828  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3478  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.65 
 
 
275 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.65 
 
 
275 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0575744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3443  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.65 
 
 
275 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_12  orotidine 5-prime-phosphate decarboxylase  43.97 
 
 
270 aa  192  4e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.65 
 
 
275 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3304  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.65 
 
 
275 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0012  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.08 
 
 
270 aa  192  4e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.50788  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.65 
 
 
275 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0197  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.44 
 
 
283 aa  192  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4108  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.53 
 
 
284 aa  191  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.80823e-07 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0825  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.11 
 
 
274 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.73 
 
 
284 aa  189  4e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1184  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.32 
 
 
275 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0552  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.34 
 
 
271 aa  188  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.44 
 
 
274 aa  188  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0594  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.11 
 
 
275 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0551  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.11 
 
 
275 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771334  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0240  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.35 
 
 
281 aa  188  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0013  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.09 
 
 
270 aa  188  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1586  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.49 
 
 
276 aa  187  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00897859 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0219  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.23 
 
 
281 aa  188  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0527  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.11 
 
 
275 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3843  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.54 
 
 
282 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.7 
 
 
275 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0899629  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.34 
 
 
288 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57419  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1801  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.55 
 
 
273 aa  186  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.293438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4696  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.55 
 
 
274 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2759  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.3 
 
 
275 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.499942 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4058  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42 
 
 
306 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186048  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0626  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.7 
 
 
275 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260961  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0143  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.7 
 
 
275 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1975  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.3 
 
 
272 aa  185  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.568621  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0824  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.55 
 
 
275 aa  184  2e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3776  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.15 
 
 
287 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3625  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.85 
 
 
278 aa  181  8e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1199  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.06 
 
 
287 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0530325  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1293  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.15 
 
 
264 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1223  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.82 
 
 
264 aa  171  9e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal  0.0822909 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1384  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.72 
 
 
287 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.675621  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09390  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  34.23 
 
 
311 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00166281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.41 
 
 
307 aa  163  2e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00211539  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1075  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.02 
 
 
274 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0882  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.78 
 
 
309 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  4.14792e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.72 
 
 
289 aa  148  1e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0951  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.75 
 
 
314 aa  146  4e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  33.47 
 
 
477 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2904  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.51 
 
 
320 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0925  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.98 
 
 
347 aa  140  2e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1377  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.19 
 
 
305 aa  140  2e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  37.85 
 
 
513 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0531  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  34.29 
 
 
317 aa  139  4e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0783  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.7 
 
 
287 aa  136  3e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  33.07 
 
 
479 aa  135  7e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  33.07 
 
 
479 aa  135  7e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0614  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.69 
 
 
312 aa  134  2e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0953  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.41 
 
 
359 aa  129  4e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0377509  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  30.2 
 
 
482 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2110  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.13 
 
 
300 aa  119  5e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3000  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.63 
 
 
286 aa  118  1e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1859  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.73 
 
 
278 aa  112  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.48 
 
 
286 aa  112  7e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0351669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1852  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.4 
 
 
278 aa  111  1e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.55 
 
 
259 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.82 
 
 
288 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.691248  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4272  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.92 
 
 
279 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11414  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.66 
 
 
274 aa  105  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.86652e-07  normal  0.109947 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2071  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.58 
 
 
258 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12700  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  33.19 
 
 
286 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0173626  normal  0.0283065 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18010  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  31.52 
 
 
308 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0200906  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2433  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.79 
 
 
273 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.716353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>