99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0061 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0061  yngK protein  100 
 
 
512 aa  1071  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0723  protein of unknown function DUF187  41.54 
 
 
509 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  40.12 
 
 
717 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4145  protein of unknown function DUF187  38.74 
 
 
519 aa  355  9e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.227733 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2393  fenI protein  38.57 
 
 
551 aa  346  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2268  hypothetical protein  38.05 
 
 
519 aa  344  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2557  hypothetical protein  38.2 
 
 
519 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.190128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2252  hypothetical protein  39.1 
 
 
519 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5345  protein of unknown function DUF187  38.75 
 
 
570 aa  342  8e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2477  hypothetical protein  38.7 
 
 
519 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1788  hypothetical protein  38.09 
 
 
517 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1956  protein of unknown function DUF187  39.88 
 
 
534 aa  342  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0273789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2416  hypothetical protein  38.48 
 
 
519 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2914  hypothetical protein  38.1 
 
 
519 aa  340  3e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.737021 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2289  hypothetical protein  38.51 
 
 
519 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2210  hypothetical protein  38.51 
 
 
519 aa  340  5e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0607732  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6128  FenI protein  39.22 
 
 
533 aa  339  9e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0784566  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2118  fenI protein  40.12 
 
 
494 aa  338  1e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115313  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1956  putative lipoprotein  40.73 
 
 
521 aa  338  2e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388068  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2396  protein of unknown function DUF187  39.18 
 
 
532 aa  336  7e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  1.22661e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1973  putative lipoprotein  39.92 
 
 
521 aa  336  8e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1156  fenI protein  39.92 
 
 
554 aa  335  8e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466056  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1597  fenI protein  39.92 
 
 
521 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0010634  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0258  fenI protein  39.92 
 
 
521 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2494  hypothetical protein  37.65 
 
 
519 aa  333  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3734  protein of unknown function DUF187  37.73 
 
 
508 aa  332  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.459123  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2122  hypothetical protein  36.89 
 
 
523 aa  330  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2076  hypothetical protein  38.14 
 
 
528 aa  327  4e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76046  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4428  protein of unknown function DUF187  38.12 
 
 
540 aa  322  1e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.998711  normal  0.0596861 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4809  hypothetical protein  37.27 
 
 
493 aa  321  2e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3506  protein of unknown function DUF187  37.5 
 
 
547 aa  320  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5534  hypothetical protein  39.88 
 
 
676 aa  315  1e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1414  FenI protein  39.04 
 
 
540 aa  315  1e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0039371  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1770  protein of unknown function DUF187  35.69 
 
 
538 aa  310  3e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1195  protein of unknown function DUF187  41.56 
 
 
406 aa  305  2e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5682  FenI protein  37.29 
 
 
520 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6227  hypothetical protein  36.87 
 
 
550 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  35.42 
 
 
669 aa  296  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1159  protein of unknown function DUF187  44.44 
 
 
551 aa  296  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2822  hypothetical protein  33.91 
 
 
521 aa  290  5e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2561  protein of unknown function DUF187  45.57 
 
 
538 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.134171 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0922  protein of unknown function DUF187  37.26 
 
 
437 aa  278  1e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1349  protein of unknown function DUF187  36.08 
 
 
508 aa  270  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1472  putative lipoprotein  37.99 
 
 
427 aa  257  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1577  hypothetical protein  37.99 
 
 
427 aa  257  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1798  putative lipoprotein  37.73 
 
 
427 aa  256  9e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0730367 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2221  protein of unknown function DUF187  36.03 
 
 
997 aa  253  8e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  32.24 
 
 
729 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  8.0624e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2030  hypothetical protein  37.77 
 
 
435 aa  244  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1822  hypothetical protein  39.7 
 
 
442 aa  240  3e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0539291  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0802  hypothetical protein  38.48 
 
 
451 aa  234  2e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1354  hypothetical protein  37.75 
 
 
431 aa  234  4e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14222  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0031  hypothetical protein  36.8 
 
 
393 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110752  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2061  hypothetical protein  37.11 
 
 
431 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00233563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01449  predicted liprotein  36.64 
 
 
439 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1310  hypothetical protein  38.7 
 
 
409 aa  230  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01462  hypothetical protein  36.64 
 
 
439 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2356  protein of unknown function DUF187  36.54 
 
 
431 aa  229  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2104  putative lipoprotein  36.34 
 
 
404 aa  229  9e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.50348 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2156  protein of unknown function DUF187  36.34 
 
 
439 aa  229  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360071  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1576  putative lipoprotein  36.34 
 
 
439 aa  229  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1680  putative lipoprotein  36.34 
 
 
439 aa  229  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1754  putative lipoprotein  36.34 
 
 
439 aa  229  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1682  putative lipoprotein  36.04 
 
 
404 aa  228  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01950  hypothetical protein  38.91 
 
 
447 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2166  hypothetical protein  37.54 
 
 
384 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1451  hypothetical protein  38.65 
 
 
393 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00978092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0753  hypothetical protein  37.91 
 
 
393 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1593  protein of unknown function DUF187  33.33 
 
 
486 aa  222  1e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4123  protein of unknown function DUF187  34.73 
 
 
481 aa  222  2e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.543211  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03377  YngK protein  38 
 
 
378 aa  221  2e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2775  protein of unknown function DUF187  28.01 
 
 
605 aa  197  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.08646e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2257  hypothetical protein  33.12 
 
 
490 aa  171  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0476  yngK protein  31.19 
 
 
515 aa  158  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0631  hypothetical protein  23.54 
 
 
906 aa  84.3  5e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.835872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3463  hypothetical protein  30.65 
 
 
1099 aa  82.4  2e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.639127  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2484  protein of unknown function DUF187  23.05 
 
 
906 aa  70.9  5e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.979378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0321  protein of unknown function DUF187  27.08 
 
 
911 aa  70.5  6e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.140793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3629  protein of unknown function DUF187  22.74 
 
 
906 aa  68.6  3e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0133  hypothetical protein  22.56 
 
 
395 aa  64.3  6e-09  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288293  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4403  protein of unknown function DUF187  20.45 
 
 
383 aa  56.2  1e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  22.56 
 
 
380 aa  54.7  4e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1609  hypothetical protein  22.49 
 
 
390 aa  54.3  5e-06  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0289476 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3564  protein of unknown function DUF187  23.17 
 
 
535 aa  53.9  6e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.463453  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  20.56 
 
 
406 aa  53.9  7e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2542  protein of unknown function DUF187  23.08 
 
 
535 aa  53.1  1e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  21.37 
 
 
437 aa  50.1  9e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3137  hypothetical protein  21.48 
 
 
430 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153295  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2522  hypothetical protein  21.04 
 
 
420 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09991  hypothetical protein  22.83 
 
 
410 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.573849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1072  hypothetical protein  22.27 
 
 
416 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0972168 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1033  protein of unknown function DUF187  23.17 
 
 
395 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419258  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0336  hypothetical protein  21.01 
 
 
345 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.329121  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  28.26 
 
 
722 aa  44.7  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1370  hypothetical protein  20.73 
 
 
384 aa  44.3  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.837101  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2134  hypothetical protein  23.16 
 
 
536 aa  43.9  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2117  protein of unknown function DUF187  22.6 
 
 
806 aa  43.9  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0730037  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1911  protein of unknown function DUF187  20.29 
 
 
427 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3586  hypothetical protein  21.23 
 
 
430 aa  43.5  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>