130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0057 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0057  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
394 aa  817  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0338  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.94 
 
 
390 aa  362  9e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0941  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.04 
 
 
390 aa  355  5e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2095  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.9 
 
 
389 aa  349  5e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0425605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2472  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.13 
 
 
391 aa  344  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3022  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.2 
 
 
401 aa  282  6e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00216966  normal  0.447003 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0321  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.57 
 
 
405 aa  273  4e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2245  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.69 
 
 
399 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64960  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.21 
 
 
399 aa  235  1e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.500667  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5645  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.58 
 
 
399 aa  235  1e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1411  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.58 
 
 
399 aa  234  2e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.997998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4945  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.85 
 
 
398 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56900  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.32 
 
 
398 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0548  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.47 
 
 
407 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220672  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1944  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 
399 aa  228  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1092  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
400 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  1.12466e-05  normal  0.614516 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00935  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.79 
 
 
400 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00018823  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1031  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.79 
 
 
400 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00456308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1039  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.79 
 
 
400 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00414982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00942  hypothetical protein  39.79 
 
 
400 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000138975  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2712  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
400 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  5.36664e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2665  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.79 
 
 
416 aa  227  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.96295e-05  normal  0.0229075 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2189  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
400 aa  226  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.084522  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2387  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
400 aa  225  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0828745  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2284  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 
392 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0887476  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1293  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.32 
 
 
413 aa  224  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1089  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.05 
 
 
416 aa  223  4e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0581  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.62 
 
 
407 aa  222  8e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.770292 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2449  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.22 
 
 
399 aa  221  2e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000692172  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1639  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.45 
 
 
401 aa  220  4e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0109745  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1118  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 
400 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0150287  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1041  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 
400 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.00411e-05 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1031  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.22 
 
 
404 aa  219  8e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120152  normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1106  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 
400 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.634691 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2203  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.99 
 
 
399 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  3.7467e-07  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1368  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.8 
 
 
398 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00031505  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0595  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.48 
 
 
407 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2492  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.8 
 
 
398 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398443  normal  0.0193027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1772  nicotinate phosphoribosyltransferase  36 
 
 
406 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182399  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3306  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
402 aa  217  3e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0926787  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1052  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.99 
 
 
412 aa  217  3e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.86017e-07  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4921  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.01 
 
 
407 aa  217  3e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1073  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.86 
 
 
400 aa  217  3e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1014  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.86 
 
 
400 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.38457e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2932  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.61 
 
 
398 aa  215  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  2.92258e-05  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1450  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 
400 aa  215  1e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1824  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.79 
 
 
399 aa  214  2e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00156311  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2781  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.79 
 
 
399 aa  214  2e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  1.16025e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2647  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.9 
 
 
406 aa  214  3e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0524303  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2873  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.79 
 
 
399 aa  214  3e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0365801  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06575  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.66 
 
 
436 aa  214  3e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2812  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.79 
 
 
399 aa  214  3e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  3.25875e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2931  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.79 
 
 
424 aa  214  3e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  1.20174e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0510  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.79 
 
 
399 aa  214  3e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109492  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2501  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.79 
 
 
399 aa  214  3e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  3.65732e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2557  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.9 
 
 
401 aa  214  3e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.10876e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1697  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.22 
 
 
399 aa  213  4e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  1.28882e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0808  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.22 
 
 
399 aa  213  4e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  3.95003e-05  normal  0.217385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0976  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.96 
 
 
398 aa  213  6e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000697  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.07 
 
 
436 aa  212  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0220829  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1981  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.64 
 
 
416 aa  212  8e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000489265  normal  0.809116 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0896  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 
389 aa  212  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477693  normal  0.0227421 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4213  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 
399 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  1.8976e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6283  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.31 
 
 
395 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000174127  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05000  nicotinate phosphoribosyltransferase, putative  35.68 
 
 
453 aa  211  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1059  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.66 
 
 
399 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  6.44735e-10  normal  0.317841 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0961  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.39 
 
 
389 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3719  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.98 
 
 
397 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00517667  normal  0.0126108 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1100  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 
399 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  2.7143e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0621  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 
399 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000681686  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2067  nicotinate phosphoribosyltransferase  35 
 
 
406 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.398487  hitchhiker  0.00430299 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0980  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.66 
 
 
399 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  6.87395e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0976  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.66 
 
 
399 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  4.51173e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1668  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.08 
 
 
401 aa  210  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000219699  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1786  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.2 
 
 
401 aa  210  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00758127  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4740  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.01 
 
 
406 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35755  normal  0.607195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0167  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.13 
 
 
406 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3080  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.35 
 
 
395 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1732  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 
401 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128231  normal  0.731039 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1620  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.5 
 
 
399 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5606  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.73 
 
 
399 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.643272 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2058  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.94 
 
 
401 aa  202  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0559  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.25 
 
 
393 aa  201  2e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618565  normal  0.0393004 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1730  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.82 
 
 
406 aa  199  9e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.404013  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0442  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 
394 aa  196  8e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87669  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.74 
 
 
425 aa  195  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4868  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.74 
 
 
402 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0041  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.04 
 
 
435 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4660  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.19 
 
 
401 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00615533 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0385  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
394 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4746  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.19 
 
 
401 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23757e-06 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4924  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.19 
 
 
401 aa  191  3e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.588245  hitchhiker  1.98844e-10 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09116  nicotinate phosphoribosyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_7G01880)  29.98 
 
 
487 aa  166  9e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.240377  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0200  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.53 
 
 
434 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0250  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.95 
 
 
434 aa  155  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4138  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 
434 aa  152  9e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.775581  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0035  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.02 
 
 
430 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4452  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 
434 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47988 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1367  nicotinate phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
430 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0109  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.37 
 
 
447 aa  148  2e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0248268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>