More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0052 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0052  sensor histidine kinase  100 
 
 
395 aa  803  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2245  histidine kinase  43.65 
 
 
382 aa  322  7e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4252  ATP-binding region ATPase domain protein  41.92 
 
 
405 aa  292  6e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01685  sensor histidine kinase  40.05 
 
 
387 aa  288  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3618  histidine kinase  39.69 
 
 
397 aa  285  1e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.261667 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1450  histidine kinase  47.99 
 
 
446 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1592  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 
384 aa  255  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0334  sensor histidine kinase  40 
 
 
391 aa  252  6e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2490  histidine kinase  47.87 
 
 
427 aa  252  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.757093  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3957  sensor histidine kinase KinD  30.86 
 
 
498 aa  114  4e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.5608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1387  sensor histidine kinase KinD  30.47 
 
 
498 aa  110  4e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1449  sensor histidine kinase KinD  31.25 
 
 
498 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  34.78 
 
 
611 aa  110  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1250  histidine kinase  30.27 
 
 
498 aa  109  9e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.792826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1490  sensor histidine kinase KinD  31.25 
 
 
498 aa  109  9e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1424  sensor histidine kinase KinD  29.8 
 
 
498 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267919 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1227  sensor histidine kinase; sporulation kinase  29.8 
 
 
498 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1351  sensor histidine kinase KinD  29.8 
 
 
498 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
498 aa  106  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1252  sensor histidine kinase KinD  29.8 
 
 
498 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1225  sensor histidine kinase; sporulation kinase  29.8 
 
 
498 aa  106  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.485232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
738 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  32.61 
 
 
581 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.43 
 
 
1215 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
390 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  31.1 
 
 
595 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  30.62 
 
 
590 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  30.62 
 
 
595 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  30.62 
 
 
595 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  30.62 
 
 
595 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  30.62 
 
 
595 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  30.62 
 
 
595 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.77576e-07 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
394 aa  99.8  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  6.51793e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.73 
 
 
744 aa  99.4  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  30.62 
 
 
499 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
595 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0288015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  30.62 
 
 
509 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03680  nitrogen regulation protein ntrY  28.63 
 
 
470 aa  97.4  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.177814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
594 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0292  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.183452  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
396 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  28.03 
 
 
621 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0656  histidine kinase  28.52 
 
 
417 aa  94.4  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.572092 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
396 aa  93.6  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4147  ATP-binding region ATPase domain protein  29.57 
 
 
1230 aa  93.2  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.175374 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
619 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  32.02 
 
 
234 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
495 aa  92.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 
516 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
655 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4577  cyclic nucleotide-binding protein  30.92 
 
 
463 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.861661 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  29.6 
 
 
458 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  29.6 
 
 
458 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
491 aa  90.1  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  29.61 
 
 
367 aa  89.7  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.91569e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.98 
 
 
598 aa  89.7  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1443  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
753 aa  89.7  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616255  hitchhiker  0.000358642 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1880  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
612 aa  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
489 aa  89.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  26.79 
 
 
581 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
581 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.94 
 
 
885 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1344  histidine kinase  38.71 
 
 
576 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
492 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0119  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
571 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.412791  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1119  sensor histidine kinase/response regulator  29.41 
 
 
420 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0515  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
689 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
575 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  32.02 
 
 
465 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  31.73 
 
 
608 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  31.73 
 
 
608 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1195  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
870 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98844  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  30.92 
 
 
608 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.92 
 
 
608 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  31.73 
 
 
608 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3236  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 
725 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.142395 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1302  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
871 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
367 aa  87  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 
518 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
364 aa  86.7  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  31.58 
 
 
465 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
987 aa  86.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  31.58 
 
 
465 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  28.1 
 
 
604 aa  85.9  1e-15  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  28.05 
 
 
458 aa  85.5  1e-15  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.66 
 
 
362 aa  85.9  1e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  28.05 
 
 
458 aa  85.9  1e-15  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4160  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.47 
 
 
516 aa  85.9  1e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.1 
 
 
604 aa  85.9  1e-15  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  31.58 
 
 
465 aa  85.9  1e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2855  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
599 aa  85.5  1e-15  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2633  histidine kinase  26.35 
 
 
566 aa  85.9  1e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 
874 aa  85.5  1e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5455  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
571 aa  85.9  1e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0104043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1578  histidine kinase  30.95 
 
 
829 aa  85.5  1e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  31.58 
 
 
465 aa  85.9  1e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
516 aa  85.9  1e-15  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0604  histidine kinase  27.16 
 
 
516 aa  85.9  1e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>