More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0037 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0037  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 121 aa  238  2.9999999999999997e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0040  ribosomal protein L19  60 
 
 		 115 aa  140  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.266371  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1331  ribosomal protein L19  57.39 
 
 		 115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  65.98 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06780  putative 50S ribosomal protein  60 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76728  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0075  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2182  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0120  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.332554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0076  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0969  50S ribosomal protein L19  52.14 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  61.86 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1738  50S ribosomal protein L19  59 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0339925 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0090  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0463  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0439  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1018  50S ribosomal protein L19  52.5 
 
 		 122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00624649  normal  0.659291 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000160789  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  59.6 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  58.76 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  60.82 
 
 		 114 aa  117  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  57.73 
 
 		 119 aa  117  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 		 114 aa  116  9e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  58.76 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  52.25 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1046  50S ribosomal protein L19  63 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000242174  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  58.76 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  56.14 
 
 		 114 aa  115  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 		 119 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  56.44 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1095  50S ribosomal protein L19  61.7 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  50 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1790  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  60.82 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0395  50S ribosomal protein L19  51.33 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 148 aa  114  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  51.33 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 115 aa  115  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  57.73 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1489  50S ribosomal protein L19  52.54 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448385  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  56.57 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  58.76 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  61.86 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  54.72 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_002936  DET0338  50S ribosomal protein L19  55.77 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00142786  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5090  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290678  normal  0.249753 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_279  ribosomal protein L19  58.59 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0178386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  58.76 
 
 		 114 aa  114  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  59.79 
 
 		 115 aa  113  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1395  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 		 120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.021497  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 		 125 aa  113  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  59.79 
 
 		 115 aa  113  7.999999999999999e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  50.85 
 
 		 129 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3678  ribosomal protein L19  53.21 
 
 		 196 aa  113  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  56 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0348  ribosomal protein L19  53.77 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1454  ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1354  normal  0.387508 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  50 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  58.95 
 
 		 133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  50.85 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  50.85 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  50 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  50.89 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  53.4 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  58 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  58 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  56.44 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  57 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02150  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0317  50S ribosomal protein L19  54.81 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000173256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  58.1 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16000  50S ribosomal protein L19  50.47 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000973438  normal  0.502722 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1024  50S ribosomal protein L19  54.72 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.688153  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1377  50S ribosomal protein L19  50.47 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.134338  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  56.7 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1521  50S ribosomal protein L19  50.86 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.309648  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  59.79 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  60.82 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  59.79 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1011  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2146  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  60.82 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2003  ribosomal protein L19  56.57 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000253757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>