205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0033 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0033  RmuC domain-containing protein  100 
 
 
432 aa  880  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  36.57 
 
 
470 aa  282  8e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  37.59 
 
 
424 aa  276  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  35.9 
 
 
420 aa  275  1e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  5.49267e-06  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  37.01 
 
 
492 aa  273  5e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  4.40717e-09  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  34.31 
 
 
457 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  39.76 
 
 
491 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3332  hypothetical protein  40.11 
 
 
491 aa  269  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  1.42299e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  38.82 
 
 
453 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.48678e-09  hitchhiker  1.61097e-07 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  39.35 
 
 
495 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  7.19972e-11  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  39.08 
 
 
495 aa  267  3e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  5.12387e-06  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  38.81 
 
 
495 aa  265  9e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  39.94 
 
 
495 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  39.12 
 
 
492 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  38.82 
 
 
492 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  4.10334e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2890  hypothetical protein  34.74 
 
 
437 aa  264  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.18912  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1321  hypothetical protein  33.83 
 
 
427 aa  257  3e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  35.65 
 
 
518 aa  254  2e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  37.13 
 
 
640 aa  253  4e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  34.61 
 
 
520 aa  253  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2414  hypothetical protein  38.07 
 
 
507 aa  249  6e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  34.46 
 
 
485 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01951  RmuC  37.36 
 
 
429 aa  247  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0270  RmuC domain-containing protein  34.87 
 
 
501 aa  245  1e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557179  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3946  hypothetical protein  34.87 
 
 
501 aa  245  1e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.737654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  36.67 
 
 
476 aa  245  1e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3642  RmuC domain-containing protein  34.87 
 
 
501 aa  245  1e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0140  hypothetical protein  36.96 
 
 
407 aa  245  1e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1629  hypothetical protein  37.54 
 
 
518 aa  244  2e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.158753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1623  putative alpha helix chain  34.46 
 
 
462 aa  244  2e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.577151  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0447  hypothetical protein  35.34 
 
 
437 aa  243  4e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0432711  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  37.27 
 
 
522 aa  243  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  36.39 
 
 
476 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  36.39 
 
 
476 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  36.39 
 
 
476 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  36.39 
 
 
476 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  33.33 
 
 
475 aa  242  9e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  33.33 
 
 
475 aa  242  9e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0247  hypothetical protein  35.11 
 
 
515 aa  242  9e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  33.33 
 
 
475 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  33.33 
 
 
475 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  33.33 
 
 
475 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  33.33 
 
 
475 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  33.33 
 
 
475 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  33.33 
 
 
475 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  36.53 
 
 
519 aa  239  6e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  36.53 
 
 
519 aa  239  6e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  36.53 
 
 
519 aa  239  7e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  36.53 
 
 
519 aa  239  7e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  36.19 
 
 
513 aa  239  9e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0018  RmuC domain-containing protein  34.94 
 
 
494 aa  239  9e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  33.11 
 
 
475 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2041  hypothetical protein  36.53 
 
 
537 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2235  hypothetical protein  36.53 
 
 
521 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0248668  normal  0.25441 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1864  hypothetical protein  36.53 
 
 
521 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2110  hypothetical protein  36.53 
 
 
521 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664501  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  36.97 
 
 
518 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  36.67 
 
 
518 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0577  RmuC family protein  33.5 
 
 
397 aa  236  6e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.585058  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  38.35 
 
 
527 aa  236  7e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  36.06 
 
 
515 aa  236  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0986  hypothetical protein  34.42 
 
 
403 aa  236  8e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0412766  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  35.4 
 
 
548 aa  235  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3764  protein of unknown function DUF195  35.75 
 
 
501 aa  235  9e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2124  hypothetical protein  34.44 
 
 
491 aa  235  1e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  34.46 
 
 
510 aa  235  1e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  35.76 
 
 
498 aa  235  1e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  34.31 
 
 
453 aa  234  2e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  36.18 
 
 
480 aa  233  5e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1894  hypothetical protein  36.67 
 
 
520 aa  233  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2433  hypothetical protein  35.33 
 
 
513 aa  232  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2528  hypothetical protein  35.71 
 
 
498 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0015  protein of unknown function DUF195  37.43 
 
 
448 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.567486  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00561  hypothetical protein  35.45 
 
 
510 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1614  hypothetical protein  32.43 
 
 
494 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0228591  normal  0.73372 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1481  protein of unknown function DUF195  34.71 
 
 
435 aa  223  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0981784  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1370  protein of unknown function DUF195  33.25 
 
 
430 aa  221  1e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001928  DNA recombination protein RmuC  33.51 
 
 
510 aa  220  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2995  DNA recombination protein RumC  32.52 
 
 
506 aa  219  6e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  34.14 
 
 
500 aa  219  8e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1035  protein of unknown function DUF195  32.91 
 
 
612 aa  219  9e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  5.97215e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2422  hypothetical protein  33.33 
 
 
639 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1094  hypothetical protein  31.88 
 
 
428 aa  211  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437038  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0237  hypothetical protein  30.85 
 
 
626 aa  211  3e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0705649  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  31.96 
 
 
530 aa  211  3e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0125  RmuC domain-containing protein  32.74 
 
 
408 aa  208  1e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.63126  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1422  protein of unknown function DUF195  33.96 
 
 
428 aa  205  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1053  hypothetical protein  33.24 
 
 
437 aa  202  1e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  32.79 
 
 
535 aa  200  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  30.79 
 
 
630 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  33.6 
 
 
504 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  30.47 
 
 
504 aa  184  2e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1026  RmuC family protein  26.4 
 
 
435 aa  181  3e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  2.25596e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  29.47 
 
 
545 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  30.23 
 
 
503 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  28.3 
 
 
445 aa  164  4e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  30.73 
 
 
451 aa  162  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  26.84 
 
 
459 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  30.89 
 
 
456 aa  156  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  7.88974e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  31.93 
 
 
467 aa  155  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>