189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0032 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  100 
 
 
861 aa  1779  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  41.19 
 
 
863 aa  625  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  38.95 
 
 
871 aa  612  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.28 
 
 
842 aa  579  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  35.72 
 
 
860 aa  493  1e-138  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  36.63 
 
 
891 aa  488  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  36.44 
 
 
864 aa  487  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  36.71 
 
 
891 aa  484  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  34.8 
 
 
875 aa  459  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.4 
 
 
845 aa  442  1e-122  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34.28 
 
 
845 aa  436  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.88 
 
 
872 aa  428  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  33.66 
 
 
813 aa  423  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  35.33 
 
 
897 aa  413  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  32.41 
 
 
819 aa  408  1e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  32.48 
 
 
824 aa  401  1e-110  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.06 
 
 
813 aa  399  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  31.53 
 
 
819 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  37.15 
 
 
833 aa  399  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  36.12 
 
 
785 aa  392  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  33.25 
 
 
819 aa  389  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  36.08 
 
 
839 aa  386  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  31.16 
 
 
815 aa  385  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  34.92 
 
 
786 aa  385  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  31.15 
 
 
793 aa  362  2e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  28.89 
 
 
802 aa  355  3e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  30.82 
 
 
823 aa  352  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34 
 
 
843 aa  350  6e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  28.8 
 
 
802 aa  350  7e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  30.78 
 
 
837 aa  348  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  35.07 
 
 
840 aa  348  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  31.83 
 
 
812 aa  348  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  32.44 
 
 
880 aa  345  2e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  35.87 
 
 
799 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  31.67 
 
 
829 aa  345  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  34.39 
 
 
837 aa  344  4e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  30.95 
 
 
846 aa  344  4e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  31.93 
 
 
824 aa  344  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  29.76 
 
 
838 aa  342  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.88 
 
 
817 aa  340  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.34 
 
 
818 aa  340  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.48 
 
 
835 aa  335  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.38 
 
 
843 aa  335  3e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  31.67 
 
 
847 aa  314  4e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  32.42 
 
 
831 aa  310  6e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  42.82 
 
 
663 aa  302  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  26.4 
 
 
940 aa  249  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  28.14 
 
 
845 aa  235  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  27.25 
 
 
763 aa  206  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  27.79 
 
 
882 aa  185  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  28.68 
 
 
882 aa  182  3e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  25.41 
 
 
816 aa  167  1e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.38 
 
 
826 aa  166  2e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.07 
 
 
826 aa  163  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  27.63 
 
 
828 aa  157  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  27.63 
 
 
828 aa  157  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  27.63 
 
 
828 aa  157  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  27.53 
 
 
853 aa  155  3e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  25.29 
 
 
820 aa  153  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  27.47 
 
 
825 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  26.39 
 
 
816 aa  151  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  24.04 
 
 
827 aa  146  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  25.69 
 
 
812 aa  142  2e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  26.2 
 
 
839 aa  142  2e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  26.24 
 
 
839 aa  141  4e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  26.24 
 
 
839 aa  141  4e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  26.24 
 
 
839 aa  141  4e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  26.24 
 
 
839 aa  141  4e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  26.24 
 
 
839 aa  141  4e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  26.51 
 
 
839 aa  141  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  26.24 
 
 
839 aa  141  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  26.01 
 
 
856 aa  137  6e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  24.46 
 
 
821 aa  132  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  25.2 
 
 
962 aa  129  2e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.16 
 
 
878 aa  127  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.67 
 
 
971 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  4.06891e-06  unclonable  1.01535e-13 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.12 
 
 
984 aa  124  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.88 
 
 
744 aa  123  1e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  22.61 
 
 
734 aa  119  2e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.08 
 
 
720 aa  114  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  23.14 
 
 
1144 aa  113  2e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  24.85 
 
 
811 aa  108  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  23.87 
 
 
724 aa  107  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  26.59 
 
 
739 aa  101  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  23.68 
 
 
815 aa  87.4  1e-15  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  23.47 
 
 
803 aa  82  5e-14  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  20.35 
 
 
906 aa  81.6  6e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.03 
 
 
1362 aa  77.8  9e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.69 
 
 
619 aa  75.9  3e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.64 
 
 
1033 aa  67.4  1e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  24.52 
 
 
889 aa  67  1e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  25.98 
 
 
848 aa  67  2e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  26.75 
 
 
717 aa  66.2  2e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  24.73 
 
 
1108 aa  64.3  1e-08  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  22.75 
 
 
888 aa  63.9  1e-08  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  22.47 
 
 
824 aa  63.2  2e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25 
 
 
651 aa  62.8  3e-08  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.96 
 
 
799 aa  62  4e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.74 
 
 
614 aa  61.6  6e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  22.83 
 
 
1112 aa  61.6  6e-08  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>