189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0030 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0030  cytidine deaminase  100 
 
 		 158 aa  315  1e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1554  cytidine deaminase  50.68 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05460  cytidine deaminase  49.64 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1634  cytidine deaminase  42.41 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.574132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6435  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.03 
 
 		 161 aa  100  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0667145  normal  0.662331 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  41.48 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  40.94 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  41.48 
 
 		 132 aa  92.8  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  41.54 
 
 		 132 aa  91.3  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  41.54 
 
 		 132 aa  91.3  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  41.54 
 
 		 132 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  41.54 
 
 		 132 aa  91.3  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  41.54 
 
 		 132 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  36.57 
 
 		 138 aa  91.3  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  41.54 
 
 		 132 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  41.54 
 
 		 132 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  41.86 
 
 		 132 aa  90.5  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  36.3 
 
 		 137 aa  90.1  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  41.86 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  41.86 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  39.84 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  37.5 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  46.61 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  40.85 
 
 		 129 aa  86.3  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  41.01 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  40.88 
 
 		 132 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  37.59 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  41.54 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  37.8 
 
 		 134 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  43.55 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  37.8 
 
 		 134 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  39.55 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  38.76 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  39.55 
 
 		 132 aa  84.7  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  41.01 
 
 		 388 aa  84  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  41.18 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  37.9 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  38.24 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0811  cytidine deaminase  41.61 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  35.66 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  41.86 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  38.31 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  41.8 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13346  cytidine deaminase  38.36 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.19995 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  40 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  40.32 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  40.32 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  40.32 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  40.32 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  40.32 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4190  cytidine deaminase  39.29 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  38.76 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1316  cytidine deaminase  46.3 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.501646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  36.36 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  36.92 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  36.92 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  40 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  33.12 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  40 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  40.15 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  39.13 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  40.32 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  40.32 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  40.32 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  41.94 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  41.94 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  36.64 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0755  cytidine deaminase  40.15 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0391304 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  37.88 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  38.28 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl143  cytidine deaminase  35.48 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00772481  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  37.6 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  41.13 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1469  cytidine deaminase  40 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0427929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  37.4 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3537  cytidine deaminase  38.36 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  38.03 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  34.06 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1273  cytidine deaminase  39.57 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  32.82 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  34.09 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  39.86 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2867  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.8 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  37.3 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1356  cytidine deaminase  38.69 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  40.62 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3655  cytidine deaminase  47.73 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1248  cytidine deaminase  40.56 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.616875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  36.59 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1257  cytidine deaminase  40.56 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1231  cytidine deaminase  40.56 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  36.72 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  38.46 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.05 
 
 		 582 aa  73.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  40.46 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  43.43 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1590  cytidine deaminase  37.68 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  0.451695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  37.98 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1594  cytidine deaminase  35.51 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  38.76 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>