20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0027 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0027  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  801  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  46.33 
 
 
394 aa  325  7e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05465  hypothetical protein  45.36 
 
 
390 aa  303  5e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4061  hypothetical protein  42.04 
 
 
392 aa  299  7e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1555  hypothetical protein  43.9 
 
 
402 aa  291  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4112  hypothetical protein  37.95 
 
 
376 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.617644  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5950  hypothetical protein  38.79 
 
 
400 aa  239  7e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4247  hypothetical protein  38.18 
 
 
385 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.827405  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3238  hypothetical protein  38.6 
 
 
386 aa  237  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124507  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1682  hypothetical protein  37.8 
 
 
383 aa  232  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1258  conserved hypothetical protein, secreted  34.82 
 
 
375 aa  223  4e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1610  hypothetical protein  35.31 
 
 
390 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.834911  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0954  hypothetical protein  30.14 
 
 
386 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2991  hypothetical protein  24.77 
 
 
346 aa  60.5  5e-08  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1756  hypothetical protein  23.3 
 
 
344 aa  56.2  1e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  6.6418e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2817  hypothetical protein  27.59 
 
 
355 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1748  hypothetical protein  25.47 
 
 
361 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0283  hypothetical protein  27.22 
 
 
346 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0357  hypothetical protein  24.69 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2396  hypothetical protein  21.31 
 
 
348 aa  43.1  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>