19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0026 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0026  hypothetical protein  100 
 
 
1123 aa  2330  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1182  hypothetical protein  28.5 
 
 
1125 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0953  hypothetical protein  29.37 
 
 
1347 aa  437  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3237  hypothetical protein  29.48 
 
 
1296 aa  436  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5949  hypothetical protein  28.98 
 
 
1152 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4246  hypothetical protein  27.55 
 
 
1110 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1556  hypothetical protein  25.43 
 
 
1278 aa  360  1e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05470  hypothetical protein  27.2 
 
 
1279 aa  359  2e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1879  hypothetical protein  24.68 
 
 
882 aa  84  1e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617309  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4643  hypothetical protein  23.29 
 
 
1017 aa  83.6  2e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  25.61 
 
 
1134 aa  80.9  1e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1205  hypothetical protein  23.06 
 
 
884 aa  73.9  2e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4047  hypothetical protein  22.74 
 
 
882 aa  67.4  1e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.353342  normal  0.0213567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1648  hypothetical protein  21.27 
 
 
865 aa  66.2  4e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2024  hemagglutinin protein HagE  23.99 
 
 
1706 aa  64.7  1e-08  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.044838 
 
 
-
 
NC_002950  PG0506  arginine-specific cysteine proteinase  23.99 
 
 
736 aa  63.9  1e-08  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.441013 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2371  hypothetical protein  23.16 
 
 
1267 aa  52.8  4e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.217084  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  30.85 
 
 
1106 aa  50.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2797  hypothetical protein  28.78 
 
 
1343 aa  48.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>