53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0020 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0020  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
234 aa  484  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.965636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4956  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0148893  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2094  regulatory protein MarR  29.41 
 
 
219 aa  79.7  4e-14  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0118468 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2643  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
211 aa  73.2  3e-12  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4547  transcriptional regulator, MarR family  25.97 
 
 
235 aa  72  8e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.294634  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  30.15 
 
 
177 aa  57.8  1e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
152 aa  52  8e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  25.42 
 
 
186 aa  52  8e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
161 aa  51.6  1e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
172 aa  51.6  1e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  29 
 
 
168 aa  50.8  2e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 
151 aa  50.8  2e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 
149 aa  48.9  6e-05  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  25.26 
 
 
144 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
173 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 
150 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
205 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
156 aa  45.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  27.36 
 
 
159 aa  45.4  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
141 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
176 aa  45.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
147 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 
146 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
180 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
153 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
180 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 
162 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 
162 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
172 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
159 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
141 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
158 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
150 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
178 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 
203 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 
168 aa  43.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 
159 aa  42.7  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  27.17 
 
 
162 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 
153 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.408457 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
136 aa  42.7  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
198 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
191 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
153 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  26.8 
 
 
173 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 
191 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
141 aa  42.4  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  23.13 
 
 
195 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
192 aa  42.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  25.17 
 
 
160 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
179 aa  42  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 
142 aa  42  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2146  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 
211 aa  42  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  0.322548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>