More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0012 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0012  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  100 
 
 
342 aa  717    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.393854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  40.47 
 
 
342 aa  271  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_002950  PG1160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  39.12 
 
 
335 aa  249  5e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  35.09 
 
 
340 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.5 
 
 
399 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  29.08 
 
 
364 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  29.91 
 
 
364 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  29.74 
 
 
364 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  29.74 
 
 
364 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.91 
 
 
358 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  29.74 
 
 
364 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.8 
 
 
361 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  29.53 
 
 
364 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.66 
 
 
364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.94 
 
 
366 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  29.55 
 
 
339 aa  143  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.34 
 
 
357 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.31 
 
 
379 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  27.65 
 
 
863 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.83 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.71 
 
 
370 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.33 
 
 
356 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  27.05 
 
 
354 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  27.38 
 
 
863 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.26 
 
 
359 aa  134  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.09 
 
 
361 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  25.89 
 
 
354 aa  133  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.49 
 
 
375 aa  132  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  28.37 
 
 
864 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  26.59 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.35 
 
 
348 aa  130  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.53 
 
 
368 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.43 
 
 
360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  23.77 
 
 
356 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  29.14 
 
 
363 aa  129  8.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.16 
 
 
357 aa  129  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  29.84 
 
 
368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  27.68 
 
 
346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  25.96 
 
 
358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.35 
 
 
362 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  28.12 
 
 
852 aa  126  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  25.66 
 
 
358 aa  126  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  26.26 
 
 
858 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.3 
 
 
360 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  26.2 
 
 
361 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  27.22 
 
 
374 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  29.51 
 
 
368 aa  123  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  29.51 
 
 
368 aa  123  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.76 
 
 
357 aa  123  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  27.04 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.23 
 
 
366 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  29.55 
 
 
386 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.81 
 
 
351 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.99 
 
 
374 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  26.2 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  30 
 
 
351 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  25 
 
 
362 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.4 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.3 
 
 
364 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  26.12 
 
 
360 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  28.1 
 
 
355 aa  113  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.87 
 
 
352 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  25.07 
 
 
366 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.04 
 
 
352 aa  112  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  25.4 
 
 
361 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.85 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17740  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.25 
 
 
807 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27949  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  30.07 
 
 
354 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  27.39 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  26.08 
 
 
383 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  28.98 
 
 
357 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  25.57 
 
 
372 aa  106  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.27 
 
 
356 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  23.87 
 
 
371 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  25.14 
 
 
363 aa  105  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  27.19 
 
 
368 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  24.93 
 
 
368 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2499  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 
336 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0170633  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0235  aminotransferase class I and II  27.56 
 
 
353 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.490059 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  26.21 
 
 
371 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  26.27 
 
 
357 aa  103  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  26.42 
 
 
367 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  27.16 
 
 
358 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  28.65 
 
 
362 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.87 
 
 
362 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02041  aminotransferase class-I  27.21 
 
 
376 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.76 
 
 
366 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  27.11 
 
 
378 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2887  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.34 
 
 
803 aa  99.8  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02041  aminotransferases class-I  24.92 
 
 
369 aa  99.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0980416  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  26.72 
 
 
352 aa  99  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  24.03 
 
 
358 aa  99  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02061  aminotransferases class-I  25.24 
 
 
369 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3684  histidinol phosphate aminotransferase  26.16 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6030  aminotransferase class I and II  25.16 
 
 
343 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  28.57 
 
 
360 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  28.21 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.16 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  23.14 
 
 
357 aa  97.4  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  23.12 
 
 
371 aa  97.4  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>