More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0011 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 
1003 aa  2079  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.25 
 
 
953 aa  605  1e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.14 
 
 
1018 aa  603  1e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  35.5 
 
 
990 aa  600  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  34.5 
 
 
971 aa  590  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  34.68 
 
 
1012 aa  572  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.6 
 
 
976 aa  561  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  32.38 
 
 
1007 aa  550  1e-155  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  33.88 
 
 
997 aa  539  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.07 
 
 
1002 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  33.13 
 
 
992 aa  522  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.6 
 
 
568 aa  321  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  31.86 
 
 
966 aa  293  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.97 
 
 
698 aa  266  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  37.09 
 
 
589 aa  263  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.2 
 
 
591 aa  257  9e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  30.85 
 
 
603 aa  256  1e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  5.33746e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  38.4 
 
 
585 aa  255  3e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.43 
 
 
583 aa  254  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  36.49 
 
 
592 aa  251  4e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  37.45 
 
 
552 aa  249  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.25 
 
 
543 aa  246  1e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.91 
 
 
573 aa  244  6e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.8 
 
 
582 aa  243  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  34.51 
 
 
604 aa  242  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  33.83 
 
 
434 aa  238  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  32.37 
 
 
597 aa  236  2e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  38.12 
 
 
520 aa  233  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  31.98 
 
 
845 aa  231  7e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  34.16 
 
 
624 aa  228  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.76 
 
 
558 aa  223  2e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.32 
 
 
534 aa  221  4e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.32 
 
 
534 aa  221  4e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.57 
 
 
600 aa  221  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.29 
 
 
537 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.87 
 
 
618 aa  219  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  33.33 
 
 
385 aa  211  7e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  29.56 
 
 
537 aa  209  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  35.95 
 
 
427 aa  207  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.9 
 
 
543 aa  207  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.44 
 
 
528 aa  206  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  35.83 
 
 
656 aa  206  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.7 
 
 
511 aa  205  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.64 
 
 
596 aa  205  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.74 
 
 
426 aa  201  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.84177e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.13 
 
 
580 aa  199  2e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  35.09 
 
 
444 aa  197  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  30.53 
 
 
541 aa  196  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  39.19 
 
 
542 aa  193  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  29.24 
 
 
517 aa  191  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  39.29 
 
 
511 aa  191  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  43.15 
 
 
538 aa  189  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  30.37 
 
 
586 aa  187  7e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  32.06 
 
 
699 aa  184  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  35.12 
 
 
420 aa  184  9e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  30.17 
 
 
379 aa  183  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  36.13 
 
 
631 aa  182  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.63 
 
 
552 aa  182  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  32.3 
 
 
699 aa  180  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  32.3 
 
 
699 aa  180  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  30.21 
 
 
688 aa  179  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  30.49 
 
 
381 aa  179  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  41.35 
 
 
520 aa  179  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  32.39 
 
 
699 aa  177  1e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.14 
 
 
365 aa  176  2e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.14 
 
 
365 aa  176  3e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  31.02 
 
 
633 aa  174  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  38.82 
 
 
365 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  34.18 
 
 
557 aa  172  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  37.5 
 
 
673 aa  172  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.59 
 
 
598 aa  171  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  40.65 
 
 
492 aa  171  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  36.2 
 
 
543 aa  170  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  30.62 
 
 
637 aa  169  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.38 
 
 
484 aa  169  3e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  40.27 
 
 
498 aa  168  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.87 
 
 
594 aa  168  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  41.2 
 
 
503 aa  168  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  30.47 
 
 
575 aa  167  7e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  31.97 
 
 
734 aa  167  7e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  39.92 
 
 
538 aa  167  8e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.14 
 
 
490 aa  166  2e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  39.82 
 
 
499 aa  165  4e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  46 
 
 
504 aa  165  4e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07520  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.09 
 
 
499 aa  163  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.139948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  41.63 
 
 
490 aa  163  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  40.36 
 
 
549 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  28.57 
 
 
531 aa  163  2e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.45 
 
 
387 aa  163  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0117  glycoside hydrolase family 3 protein  34.44 
 
 
465 aa  162  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  27.67 
 
 
779 aa  162  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  28.28 
 
 
793 aa  162  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1531  glycoside hydrolase family 3 protein  34.56 
 
 
478 aa  162  4e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000631966  unclonable  5.75811e-19 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  31.36 
 
 
452 aa  161  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  31.36 
 
 
428 aa  160  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0119  glycoside hydrolase family 3 protein  33.77 
 
 
467 aa  160  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  30.08 
 
 
575 aa  159  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  6.31945e-05 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  36.81 
 
 
365 aa  159  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.97 
 
 
530 aa  157  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0705  glycosy hydrolase family protein  26.39 
 
 
596 aa  157  8e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>