More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0010 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3404  ATPase AAA-2 domain protein  43.65 
 
 
843 aa  664  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  44.31 
 
 
822 aa  695  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0025  ATPase AAA-2 domain protein  41.75 
 
 
789 aa  643  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  44.74 
 
 
811 aa  707  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  52.32 
 
 
823 aa  693  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  44.63 
 
 
811 aa  705  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1489  ATPase AAA-2 domain protein  51.51 
 
 
813 aa  670  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2617  ATPase AAA-2 domain protein  48.33 
 
 
846 aa  810  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0330  ATPase AAA-2 domain protein  49.3 
 
 
849 aa  824  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.711717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0355  ATPase AAA-2 domain protein  49.65 
 
 
853 aa  824  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  7.16084e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0465  hypothetical protein  54.94 
 
 
842 aa  754  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  44.67 
 
 
869 aa  701  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0255  ATPase AAA-2 domain protein  49.77 
 
 
849 aa  827  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0011  ATPase AAA-2 domain protein  41.9 
 
 
792 aa  646  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  44.75 
 
 
821 aa  696  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1825  ATPase AAA-2 domain protein  45.71 
 
 
829 aa  723  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00870  ATPase AAA-2 domain protein  45.01 
 
 
806 aa  671  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.09164e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  44.41 
 
 
810 aa  717  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  44.09 
 
 
830 aa  684  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  44.43 
 
 
825 aa  710  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  42.59 
 
 
872 aa  637  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.472161  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1850  ATPase AAA-2 domain protein  50.39 
 
 
826 aa  641  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1436  ATPase AAA-2 domain protein  43.29 
 
 
834 aa  657  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.327817 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0314  ATP-dependent chaperone ClpB  47.36 
 
 
861 aa  651  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174502  normal  0.43861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  52.31 
 
 
826 aa  709  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  44.63 
 
 
811 aa  705  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  44.63 
 
 
811 aa  707  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.55448e-05  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  54.8 
 
 
814 aa  712  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  44.43 
 
 
814 aa  721  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  43.87 
 
 
844 aa  673  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  43.78 
 
 
836 aa  672  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  45.51 
 
 
834 aa  690  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2016  ATPase  53.77 
 
 
847 aa  666  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.551696  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1200  ATPase  51.73 
 
 
825 aa  643  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0973112  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  47.86 
 
 
871 aa  644  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  46.08 
 
 
822 aa  699  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0630  ATPase  50.37 
 
 
890 aa  653  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.841599  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  44.72 
 
 
811 aa  704  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  43.68 
 
 
840 aa  682  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  44.51 
 
 
851 aa  677  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  53.13 
 
 
818 aa  704  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0028  ATPase  51.17 
 
 
822 aa  642  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0503  ATPase  52.08 
 
 
837 aa  668  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0836  ATP-dependent chaperone ClpB  48.62 
 
 
860 aa  640  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00212148  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0059  ATPase AAA-2 domain protein  44.1 
 
 
860 aa  682  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310475  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1526  ATPase  53.85 
 
 
839 aa  715  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00101266  unclonable  2.18976e-18 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2678  ATPase  42.61 
 
 
840 aa  691  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0750  ATPase  45.63 
 
 
820 aa  672  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0092536  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  44.64 
 
 
812 aa  726  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  46.42 
 
 
816 aa  733  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  44.6 
 
 
811 aa  703  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1629  ATPase  50.08 
 
 
826 aa  640  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  45.56 
 
 
810 aa  725  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  41.29 
 
 
824 aa  650  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  50.38 
 
 
859 aa  669  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0024  ATPase  46.76 
 
 
818 aa  695  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  9.51044e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  42.09 
 
 
815 aa  669  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  44.48 
 
 
835 aa  711  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_56  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  51.27 
 
 
824 aa  682  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1194  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  48.11 
 
 
812 aa  637  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.453766  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  44.68 
 
 
852 aa  702  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  43.59 
 
 
815 aa  676  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  44.44 
 
 
820 aa  708  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  42.09 
 
 
819 aa  674  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  45.15 
 
 
858 aa  699  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  43.96 
 
 
837 aa  694  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1343  ATPase AAA-2 domain protein  50.87 
 
 
850 aa  813  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  43.91 
 
 
848 aa  694  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  46.84 
 
 
812 aa  734  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  43.29 
 
 
862 aa  698  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1370  ATPase AAA-2 domain protein  51.61 
 
 
843 aa  863  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79218  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11148  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  52.93 
 
 
848 aa  885  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  44.1 
 
 
836 aa  706  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1369  ATPase AAA-2 domain protein  44.02 
 
 
830 aa  644  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  44.18 
 
 
834 aa  707  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3203  ATPase AAA-2 domain protein  50.53 
 
 
853 aa  638  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  43.06 
 
 
855 aa  686  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  43.82 
 
 
858 aa  671  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0861  ATPase AAA-2 domain protein  52.07 
 
 
828 aa  668  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00086929  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0603  ATPase AAA-2 domain protein  44.7 
 
 
852 aa  706  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0740742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  43.14 
 
 
854 aa  684  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  43.59 
 
 
841 aa  687  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  43.58 
 
 
868 aa  681  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  43.62 
 
 
846 aa  692  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  45.09 
 
 
810 aa  724  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0023  ATPase AAA-2 domain protein  42.16 
 
 
789 aa  644  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  43.02 
 
 
851 aa  678  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11320  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  45.24 
 
 
846 aa  650  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.952833  normal  0.628396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6630  ATPase AAA-2 domain protein  51.99 
 
 
844 aa  885  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  43.94 
 
 
850 aa  692  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0684  ATPase AAA-2 domain protein  50.23 
 
 
841 aa  640  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  43.34 
 
 
829 aa  687  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  43.88 
 
 
852 aa  695  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1132  ATPase AAA-2 domain protein  52.38 
 
 
846 aa  893  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.502514  normal  0.57149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5019  ATPase AAA-2 domain protein  52.16 
 
 
846 aa  863  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0473703  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  44.33 
 
 
824 aa  702  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  45.51 
 
 
851 aa  692  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  44.31 
 
 
822 aa  694  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1859  ATP-dependent chaperone ClpB  41 
 
 
868 aa  639  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  45.78 
 
 
812 aa  724  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>