More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0008 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1644  ISPg5, transposase Orf2  96.79 
 
 
312 aa  636  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2128  ISPg5, transposase Orf2  100 
 
 
312 aa  657  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2057  ISPg5, transposase Orf2  97.44 
 
 
312 aa  638  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.501617 
 
 
-
 
NC_002950  PG1710  ISPg5, transposase Orf2  97.44 
 
 
312 aa  644  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.843756 
 
 
-
 
NC_002950  PG0458  ISPg5, transposase Orf2  97.44 
 
 
312 aa  639  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_002950  PG0426  ISPg5, transposase Orf2  97.44 
 
 
312 aa  643  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.273588 
 
 
-
 
NC_002950  PG0041  ISPg5 transposase Orf2  96.79 
 
 
312 aa  636  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0008  ISPg5 transposase Orf2  100 
 
 
312 aa  657  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0403469 
 
 
-
 
NC_002950  PG0591  ISPg5, transposase Orf2  96.15 
 
 
312 aa  630  1e-180  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0943  ISPg5, transposase Orf2  96.47 
 
 
312 aa  631  1e-180  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0331462 
 
 
-
 
NC_002950  PG1420  ISPg5, transposase Orf2  96.47 
 
 
312 aa  631  1e-180  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3398  Integrase catalytic region  38.97 
 
 
266 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481157  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0068  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
265 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2032  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
265 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778861  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2131  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
265 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1347  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
265 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0059  transposase  36.76 
 
 
411 aa  155  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  hitchhiker  3.53059e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2161  transposase  36.76 
 
 
411 aa  155  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.847526  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3334  transposase  36.76 
 
 
411 aa  155  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3467  transposase  36.76 
 
 
411 aa  155  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313669  hitchhiker  0.000138187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3827  hypothetical protein  36.76 
 
 
411 aa  155  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5925  hypothetical protein  39.26 
 
 
263 aa  153  3e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.14498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4947  hypothetical protein  39.26 
 
 
263 aa  153  3e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4511  ISPsy11, transposase OrfB  36.9 
 
 
265 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.5786  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2322  IS3 family transposase  34.47 
 
 
246 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2538  IS3 family transposase  34.47 
 
 
246 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2305  IS3 family transposase  34.47 
 
 
246 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3616  IS3 family transposase  34.47 
 
 
246 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623874  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2543  IS3 family transposase  34.47 
 
 
246 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.66662  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3282  IS3 family transposase  34.47 
 
 
246 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2988  ISPsy11, transposase OrfB  36.75 
 
 
278 aa  152  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.556396  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1673  ISPsy11, transposase OrfB  36.75 
 
 
278 aa  152  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198779  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0869  ISPsy11, transposase OrfB  36.75 
 
 
278 aa  152  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211995  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5133  hypothetical protein  38.89 
 
 
263 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6760  Integrase catalytic region  36.82 
 
 
305 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3606  Integrase catalytic region  35.27 
 
 
296 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.607148  normal  0.464703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0121  Integrase catalytic region  35.27 
 
 
296 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.133865 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3056  IS3 family transposase  34.47 
 
 
246 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1224  integrase catalytic subunit  37.27 
 
 
287 aa  146  4e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127242  normal  0.935369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3089  integrase catalytic subunit  37.27 
 
 
287 aa  146  4e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000165574  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1121  Integrase catalytic region  37.13 
 
 
275 aa  146  4e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.319889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3619  Integrase catalytic region  37.13 
 
 
275 aa  146  4e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0757  integrase catalytic subunit  37.27 
 
 
287 aa  146  4e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1020  Integrase catalytic region  37.13 
 
 
275 aa  146  4e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127809  normal  0.102999 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2022  hypothetical protein  37 
 
 
405 aa  145  8e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0743871  hitchhiker  0.0039543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1794  hypothetical protein  37 
 
 
405 aa  145  8e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  7.99594e-06  hitchhiker  1.66407e-07 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0894  hypothetical protein  37 
 
 
405 aa  145  8e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3248  hypothetical protein  37 
 
 
405 aa  145  8e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.634326  decreased coverage  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3004  hypothetical protein  37 
 
 
405 aa  145  8e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.71981e-06  decreased coverage  8.62956e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2976  hypothetical protein  37 
 
 
405 aa  145  8e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0838011  normal  0.0444014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2672  Integrase catalytic region  36.76 
 
 
275 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393595  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1878  ISPsy11, transposase OrfB  36.47 
 
 
272 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0252583  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2787  Integrase catalytic region  36.76 
 
 
275 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2126  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 
240 aa  143  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0319938  hitchhiker  0.00709145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2142  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 
240 aa  143  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  3.18686e-06  hitchhiker  0.000276825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2298  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 
240 aa  143  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3303  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 
239 aa  143  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0464  integrase catalytic subunit  38.96 
 
 
242 aa  142  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3707  integrase catalytic region  36.63 
 
 
250 aa  141  1e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3257  integrase catalytic region  36.63 
 
 
250 aa  141  1e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0403  integrase catalytic region  36.63 
 
 
250 aa  141  1e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2466  integrase catalytic region  36.63 
 
 
250 aa  141  1e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.206466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2423  integrase catalytic region  36.63 
 
 
250 aa  141  1e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1106  integrase catalytic region  36.63 
 
 
250 aa  141  1e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.08961e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1495  integrase catalytic region  36.63 
 
 
250 aa  141  1e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1614  integrase catalytic region  36.63 
 
 
250 aa  141  1e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00380758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0015  integrase catalytic region  36.63 
 
 
250 aa  141  1e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1916  integrase catalytic region  36.63 
 
 
250 aa  141  1e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0024  integrase catalytic region  36.63 
 
 
250 aa  141  1e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3340  integrase catalytic subunit  38.53 
 
 
242 aa  140  2e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4443  Integrase catalytic region  36.21 
 
 
256 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1881  Integrase catalytic region  36.21 
 
 
256 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.803149 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0907  hypothetical protein  36.13 
 
 
307 aa  139  5e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.129322 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3562  integrase catalytic subunit  38.1 
 
 
242 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0833  integrase, catalytic region  40.28 
 
 
227 aa  136  3e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  6.3104e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3382  integrase, catalytic region  40.28 
 
 
227 aa  136  3e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0725  integrase, catalytic region  40.28 
 
 
227 aa  136  3e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  4.4412e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1371  integrase catalytic region  35.54 
 
 
240 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739659 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1233  integrase catalytic region  35.54 
 
 
240 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3305  integrase catalytic region  35.54 
 
 
240 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1729  integrase catalytic region  35.54 
 
 
240 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.0687454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2586  integrase catalytic region  35.54 
 
 
240 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3490  integrase catalytic region  35.54 
 
 
240 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240765  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1555  integrase catalytic subunit  34.2 
 
 
267 aa  134  1e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000209359  normal  0.14515 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3518  hypothetical protein  34.91 
 
 
409 aa  135  1e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0609241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2390  integrase catalytic subunit  38.26 
 
 
240 aa  135  1e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.433388  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0434  integrase catalytic subunit  34.2 
 
 
267 aa  134  1e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  9.20784e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2643  integrase catalytic region  34.57 
 
 
267 aa  135  1e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4489  integrase catalytic region  34.57 
 
 
267 aa  135  1e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344877  normal  0.0155071 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0015  integrase catalytic subunit  34.2 
 
 
267 aa  134  2e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.2055e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2045  integrase catalytic subunit  34.07 
 
 
269 aa  134  2e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.391436  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1756  integrase catalytic subunit  34.2 
 
 
267 aa  134  2e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.651676  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0933  integrase catalytic subunit  34.2 
 
 
267 aa  134  2e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  1.74651e-05  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2389  integrase catalytic subunit  34.2 
 
 
267 aa  134  2e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1999  integrase catalytic subunit  34.2 
 
 
267 aa  134  2e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555905  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3128  integrase catalytic subunit  34.2 
 
 
267 aa  134  2e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  2.15252e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3735  integrase catalytic subunit  34.2 
 
 
267 aa  134  2e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.333403  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0937  putative transposase OrfB  37.66 
 
 
234 aa  134  2e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.43261  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2117  integrase catalytic subunit  34.2 
 
 
267 aa  134  2e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4070  integrase catalytic region  37.23 
 
 
242 aa  133  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>