More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0001 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 		 473 aa  986    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000560056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.06 
 
 		 477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3606  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.35 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1938  chromosomal replication initiation protein  41.23 
 
 		 473 aa  383  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12738  chromosomal replication initiation protein  39.66 
 
 		 475 aa  379  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.843582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.81 
 
 		 480 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0005  chromosomal replication initiation protein  40.22 
 
 		 475 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.65 
 
 		 469 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2357  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.91 
 
 		 476 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.048166  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  38.27 
 
 		 491 aa  365  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  37.98 
 
 		 492 aa  365  1e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  39.04 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0001  chromosomal replication initiation protein  39.32 
 
 		 487 aa  359  6e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  39.52 
 
 		 490 aa  355  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0001  chromosomal replication initiation protein  38.35 
 
 		 491 aa  350  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.96301  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  37.66 
 
 		 489 aa  350  3e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3008  chromosomal replication initiation protein  37.72 
 
 		 471 aa  345  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.75 
 
 		 503 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  37.34 
 
 		 492 aa  342  1e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  34.22 
 
 		 449 aa  286  5e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  32.62 
 
 		 446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  32.62 
 
 		 446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  32.62 
 
 		 446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  32.62 
 
 		 446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  32.62 
 
 		 446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  32.4 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  32.4 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  32.83 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  33.71 
 
 		 462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  34.08 
 
 		 462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.79 
 
 		 464 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  32.83 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.05 
 
 		 454 aa  272  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  33.56 
 
 		 462 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  33.56 
 
 		 462 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  33.56 
 
 		 462 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  33.56 
 
 		 462 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  33.79 
 
 		 461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  33.41 
 
 		 460 aa  269  8e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  33.78 
 
 		 462 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  33.03 
 
 		 457 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 		 467 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  33.41 
 
 		 460 aa  269  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  33.11 
 
 		 460 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  34.61 
 
 		 451 aa  268  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  33.71 
 
 		 461 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  33.11 
 
 		 460 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 		 467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.96 
 
 		 467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 		 467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  32.96 
 
 		 467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 		 467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  31.49 
 
 		 446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 		 467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 		 467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 461 aa  266  7e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.26 
 
 		 462 aa  266  8e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  33.19 
 
 		 442 aa  266  8.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.05 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  33.26 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  33.26 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.62 
 
 		 456 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.24 
 
 		 461 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  33.12 
 
 		 495 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000582235  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  32.13 
 
 		 446 aa  265  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  32.73 
 
 		 467 aa  263  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  33.18 
 
 		 465 aa  263  4.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 466 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 466 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 466 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 466 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 466 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  32.47 
 
 		 440 aa  263  6.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  32.91 
 
 		 478 aa  262  8.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  31.33 
 
 		 511 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  33.48 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.48 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  33.78 
 
 		 463 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  33.48 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  34.42 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.33 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.11 
 
 		 483 aa  261  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  32.2 
 
 		 459 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  32.81 
 
 		 465 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  33.26 
 
 		 455 aa  259  9e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  29.89 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4144  chromosomal replication initiation protein  32.82 
 
 		 473 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  32.74 
 
 		 462 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0001  chromosomal replication initiation protein  32.67 
 
 		 473 aa  257  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  32.74 
 
 		 462 aa  257  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.26 
 
 		 469 aa  257  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  31.59 
 
 		 510 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  30.75 
 
 		 450 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0001  chromosomal replication initiation protein  32.68 
 
 		 475 aa  256  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.738182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.49 
 
 		 463 aa  256  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  32.51 
 
 		 468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  31 
 
 		 457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  33.26 
 
 		 468 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.29 
 
 		 474 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>