More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4560 on replicon NC_011727
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  100 
 
 		 1485 aa  2965    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  31.57 
 
 		 1271 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  30.65 
 
 		 2096 aa  382  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  27.6 
 
 		 3027 aa  277  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  27.06 
 
 		 1959 aa  274  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  25.72 
 
 		 2035 aa  271  5.9999999999999995e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  27.54 
 
 		 2277 aa  260  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.98 
 
 		 1600 aa  252  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  27 
 
 		 1840 aa  249  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.17 
 
 		 2149 aa  248  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1942 aa  246  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.27 
 
 		 1917 aa  244  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  26.39 
 
 		 1669 aa  238  5.0000000000000005e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1352 aa  236  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  26.69 
 
 		 3689 aa  224  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  29.28 
 
 		 2294 aa  208  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  26.53 
 
 		 1518 aa  206  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  25.5 
 
 		 2731 aa  204  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.55 
 
 		 1467 aa  199  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  24.72 
 
 		 1485 aa  198  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  28.19 
 
 		 3193 aa  197  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.32 
 
 		 1576 aa  197  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1197 aa  196  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.86 
 
 		 1572 aa  195  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  28.59 
 
 		 3073 aa  194  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  26.01 
 
 		 3273 aa  193  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  25.36 
 
 		 1599 aa  188  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  27.44 
 
 		 2942 aa  183  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  23.39 
 
 		 1595 aa  181  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  23.86 
 
 		 1520 aa  180  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  23.76 
 
 		 1614 aa  180  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.75 
 
 		 1560 aa  179  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.05 
 
 		 1489 aa  178  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  23.78 
 
 		 1586 aa  178  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  23.59 
 
 		 1586 aa  178  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  24.28 
 
 		 1385 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  24.24 
 
 		 1550 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  26.04 
 
 		 1409 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  26.26 
 
 		 1953 aa  175  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  24.93 
 
 		 1362 aa  175  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.91 
 
 		 1547 aa  174  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  24.76 
 
 		 1400 aa  172  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  23.83 
 
 		 1981 aa  172  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  22.92 
 
 		 1551 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  24.62 
 
 		 1509 aa  168  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  25.61 
 
 		 6272 aa  167  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.18 
 
 		 1527 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  23.42 
 
 		 1609 aa  166  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  24.64 
 
 		 1429 aa  164  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  23.33 
 
 		 1386 aa  163  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.86 
 
 		 1558 aa  163  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  24.71 
 
 		 1508 aa  163  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  25.34 
 
 		 1384 aa  162  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  24.11 
 
 		 1411 aa  162  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3683  peptidoglycan-binding LysM  25.09 
 
 		 5236 aa  161  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  24.12 
 
 		 1528 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1923  peptidoglycan-binding LysM  25.09 
 
 		 5189 aa  161  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  23.53 
 
 		 1390 aa  160  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1611 aa  160  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  24.55 
 
 		 1620 aa  159  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  22.86 
 
 		 1495 aa  155  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  25.19 
 
 		 866 aa  155  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  24.37 
 
 		 1681 aa  154  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  24.32 
 
 		 1528 aa  154  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  25 
 
 		 1626 aa  154  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  23.34 
 
 		 1554 aa  152  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.95 
 
 		 1568 aa  151  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  28.87 
 
 		 678 aa  151  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  22.41 
 
 		 1531 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  24.56 
 
 		 2144 aa  150  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.15 
 
 		 924 aa  149  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  23.77 
 
 		 1259 aa  149  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.71 
 
 		 1552 aa  149  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  25.71 
 
 		 1543 aa  148  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  24.97 
 
 		 903 aa  147  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  25.42 
 
 		 1834 aa  146  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  22.2 
 
 		 1348 aa  146  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  23.08 
 
 		 1710 aa  145  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.1 
 
 		 1492 aa  144  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  25.33 
 
 		 1008 aa  144  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  25.25 
 
 		 1345 aa  144  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  25.33 
 
 		 1008 aa  144  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  25.25 
 
 		 1345 aa  144  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  26.95 
 
 		 927 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 2486 aa  142  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  26.71 
 
 		 867 aa  142  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  21.7 
 
 		 1553 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  24.75 
 
 		 1381 aa  141  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  21.36 
 
 		 1541 aa  141  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  21.36 
 
 		 1541 aa  141  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  21.36 
 
 		 1381 aa  141  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  21.36 
 
 		 1541 aa  141  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  24.46 
 
 		 1365 aa  140  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  26.37 
 
 		 2003 aa  140  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  21.5 
 
 		 1541 aa  140  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  21.68 
 
 		 1541 aa  140  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  26.56 
 
 		 1464 aa  140  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  23.47 
 
 		 1466 aa  139  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  23.64 
 
 		 1390 aa  140  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1494 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>