More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4520 on replicon NC_011723
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
273 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  68.44 
 
 
266 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  57.3 
 
 
278 aa  278  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0445  hypothetical protein  49.25 
 
 
239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1882  hypothetical protein  46.05 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  39.38 
 
 
745 aa  109  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  40.35 
 
 
309 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  39.73 
 
 
381 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  41.29 
 
 
286 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  40.09 
 
 
517 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  40.38 
 
 
332 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  38.74 
 
 
311 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  38.01 
 
 
401 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  40.64 
 
 
214 aa  102  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  39.19 
 
 
449 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  36.48 
 
 
386 aa  102  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  37.56 
 
 
401 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  39.32 
 
 
567 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  41.24 
 
 
340 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  42.78 
 
 
203 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  41.5 
 
 
277 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  38.03 
 
 
448 aa  99.4  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  40.58 
 
 
213 aa  99  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  37.44 
 
 
319 aa  99  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  38.07 
 
 
401 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  38.07 
 
 
401 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  38.1 
 
 
336 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  42.27 
 
 
204 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  38.1 
 
 
336 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  41.58 
 
 
521 aa  96.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  39.53 
 
 
489 aa  95.5  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  37.85 
 
 
199 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  37.91 
 
 
294 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  39.17 
 
 
234 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  38.32 
 
 
199 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  41.71 
 
 
416 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  37.28 
 
 
576 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  38.86 
 
 
333 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  34.27 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  36.44 
 
 
493 aa  92.8  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  40.47 
 
 
216 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  37.44 
 
 
225 aa  92  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  39.9 
 
 
776 aa  92.4  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  38.3 
 
 
412 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  39.71 
 
 
299 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  38.12 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  35.68 
 
 
420 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  34.11 
 
 
300 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  39.58 
 
 
320 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  32.73 
 
 
734 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1082  pentapeptide protein  38.79 
 
 
614 aa  89.4  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  34.87 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  40.28 
 
 
493 aa  88.6  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  35.23 
 
 
366 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  34.87 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  43.55 
 
 
1033 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  40.89 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  35.23 
 
 
366 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  40.89 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  35.23 
 
 
366 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  37.7 
 
 
263 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  37.97 
 
 
862 aa  87  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  40.85 
 
 
180 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  33.98 
 
 
412 aa  86.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  41.62 
 
 
268 aa  85.9  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  40.53 
 
 
264 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  39.39 
 
 
215 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  37.38 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.84 
 
 
525 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  39.44 
 
 
174 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  38.64 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  33.5 
 
 
366 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  34.58 
 
 
727 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  34.13 
 
 
456 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  35.15 
 
 
452 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  32.7 
 
 
515 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  36.65 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  40.36 
 
 
903 aa  83.2  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  36.57 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  35.09 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  35.98 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  34.29 
 
 
440 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  41.76 
 
 
194 aa  82  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  41.41 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  58.82 
 
 
973 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  40.25 
 
 
165 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  41.41 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  38.55 
 
 
184 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  36.41 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  33.5 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  39.13 
 
 
446 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  38.24 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  44.9 
 
 
447 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  34.39 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  32.39 
 
 
419 aa  79.7  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  40.54 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  37.36 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  28.74 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  40.13 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>