More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4372 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4434  Ribonuclease H  100 
 
 		 163 aa  342  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4372  Ribonuclease H  100 
 
 		 163 aa  342  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1584  RNase HI  64.33 
 
 		 157 aa  227  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  69.74 
 
 		 159 aa  227  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  62.25 
 
 		 154 aa  197  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  55.48 
 
 		 241 aa  193  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  52.38 
 
 		 245 aa  175  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  54.97 
 
 		 157 aa  171  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  50 
 
 		 236 aa  170  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2382  ribonuclease H  56.05 
 
 		 158 aa  170  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2839  Ribonuclease H  55.03 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  51.95 
 
 		 170 aa  168  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  52.9 
 
 		 158 aa  167  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  52.63 
 
 		 156 aa  166  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  55.86 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  50.34 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  52.6 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  53.95 
 
 		 155 aa  163  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  53.95 
 
 		 155 aa  163  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  53.95 
 
 		 155 aa  163  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  53.95 
 
 		 155 aa  163  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  51.66 
 
 		 156 aa  163  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  55.86 
 
 		 154 aa  163  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  53.95 
 
 		 155 aa  163  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  50 
 
 		 156 aa  163  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  55.86 
 
 		 154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  56 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  54.61 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000149307  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  51.66 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  49.69 
 
 		 161 aa  160  7e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2019  ribonuclease H  48.41 
 
 		 159 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0600903  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  50.33 
 
 		 185 aa  159  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  52.41 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1992  ribonuclease H  50.33 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000066103  hitchhiker  0.00000132763 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  52.41 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  53.69 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  52.41 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  53.69 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  50.66 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  55.4 
 
 		 146 aa  158  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2608  ribonuclease H  49.34 
 
 		 161 aa  157  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000274708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  56.62 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  50 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  57.04 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  54.17 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  54.01 
 
 		 163 aa  157  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  54.68 
 
 		 146 aa  157  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  51.68 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  50 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000263424  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2235  ribonuclease H  50 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000274591  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1826  ribonuclease H  52.48 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  49.01 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1754  ribonuclease H  53.28 
 
 		 145 aa  155  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  51.32 
 
 		 155 aa  155  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2969  Ribonuclease H  52.63 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  54.01 
 
 		 147 aa  155  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  52.41 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  52.41 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  52.41 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  52.41 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  52.41 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  53.19 
 
 		 166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  52.41 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  52.41 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  52.41 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  52.41 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1779  ribonuclease H  48.68 
 
 		 156 aa  154  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000616595  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  53.85 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  54.74 
 
 		 161 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  53.57 
 
 		 143 aa  153  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  51.41 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  55.32 
 
 		 154 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  50.96 
 
 		 164 aa  152  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  55.07 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  47.74 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2399  ribonuclease H  53.19 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2560  ribonuclease H  48.03 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  49.66 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  55.88 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1135  ribonuclease H  49.68 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1334  ribonuclease H  57.04 
 
 		 143 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2941  ribonuclease H  52.7 
 
 		 154 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0619  ribonuclease H  54.14 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.772003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  52.17 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  52.52 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  57.04 
 
 		 143 aa  151  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  53.62 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  48.03 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  48.03 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  55.15 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  48.03 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  48.03 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  51.43 
 
 		 142 aa  150  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  53.79 
 
 		 150 aa  151  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0304  ribonuclease H  49.65 
 
 		 145 aa  150  5.9999999999999996e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0206259  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  55.15 
 
 		 154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  52.52 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  55.15 
 
 		 154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  53.15 
 
 		 147 aa  150  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0852  ribonuclease H  52.78 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>