More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4312 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01110  transcription-repair coupling factor  35.64 
 
 		 1148 aa  646    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.358379  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2533  transcription-repair coupling factor  35.46 
 
 		 1164 aa  647    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00875995  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  46.04 
 
 		 1169 aa  1103    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  37.06 
 
 		 1148 aa  671    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  38 
 
 		 1157 aa  669    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4624  transcription-repair coupling factor  36.5 
 
 		 1211 aa  667    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  36.79 
 
 		 1121 aa  679    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  39.23 
 
 		 1176 aa  737    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  36.82 
 
 		 1169 aa  689    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2153  transcription-repair coupling factor  36.46 
 
 		 1148 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.164525  hitchhiker  0.0000432293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  39.23 
 
 		 1176 aa  737    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2139  transcription-repair coupling factor  36.18 
 
 		 1207 aa  646    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0008  transcription-repair coupling factor  37.42 
 
 		 1165 aa  649    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  36.57 
 
 		 1157 aa  656    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  39.47 
 
 		 1176 aa  746    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  38.85 
 
 		 1176 aa  734    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  38.94 
 
 		 1178 aa  736    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  38.94 
 
 		 1176 aa  736    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  56.19 
 
 		 1193 aa  1319    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  37.65 
 
 		 1153 aa  652    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  37.1 
 
 		 1153 aa  649    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  34.5 
 
 		 1179 aa  636    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0696  transcription-repair coupling factor  35.62 
 
 		 1151 aa  659    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221423  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  35.11 
 
 		 1174 aa  655    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  52.9 
 
 		 1167 aa  1239    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  39.67 
 
 		 1178 aa  753    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  36.72 
 
 		 1179 aa  686    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  75.77 
 
 		 1168 aa  1857    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  67.22 
 
 		 1188 aa  1659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  52.98 
 
 		 1167 aa  1243    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1642  transcription-repair coupling factor  35.53 
 
 		 1158 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0884  transcription-repair coupling factor  34.45 
 
 		 1216 aa  636    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11038  transcription-repair coupling factor mfd  36.6 
 
 		 1234 aa  666    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.970521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  37.19 
 
 		 1161 aa  653    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  57.47 
 
 		 1192 aa  1390    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1067  transcription-repair coupling factor  35.74 
 
 		 1193 aa  644    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  57.3 
 
 		 1192 aa  1357    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  36.9 
 
 		 1158 aa  687    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  37.12 
 
 		 1207 aa  681    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1168  transcription-repair coupling factor  34.67 
 
 		 1159 aa  644    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.507558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  38.85 
 
 		 1176 aa  734    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  47.26 
 
 		 1174 aa  1124    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  64.23 
 
 		 1153 aa  1574    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  36.66 
 
 		 1176 aa  699    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  38.11 
 
 		 1159 aa  714    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  39.89 
 
 		 1183 aa  744    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2157  transcription-repair coupling factor  35.83 
 
 		 1148 aa  642    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  38.45 
 
 		 1165 aa  744    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3926  transcription-repair coupling factor  35.86 
 
 		 1208 aa  650    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.892466 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  66.13 
 
 		 1166 aa  1610    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  46.47 
 
 		 1246 aa  641    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2012  transcription-repair coupling factor  35.64 
 
 		 1148 aa  646    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267728 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  39.17 
 
 		 1176 aa  732    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  36.09 
 
 		 1153 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1236  transcription-repair coupling factor  35.55 
 
 		 1148 aa  646    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00316475  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  47.78 
 
 		 1175 aa  1127    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  39.1 
 
 		 1176 aa  731    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1969  transcription-repair coupling factor  36.09 
 
 		 1148 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  37.07 
 
 		 1148 aa  679    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1567  transcription-repair coupling factor  35.62 
 
 		 1150 aa  652    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  37.48 
 
 		 1265 aa  691    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1292  transcription-repair coupling factor  36.09 
 
 		 1148 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.208562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1315  transcription-repair coupling factor  36.09 
 
 		 1148 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  35.7 
 
 		 1182 aa  672    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  37.41 
 
 		 1165 aa  688    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  36.93 
 
 		 1168 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4245  transcription-repair coupling factor  36.48 
 
 		 1211 aa  669    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  36.93 
 
 		 1168 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1725  transcription-repair coupling factor  36.37 
 
 		 1160 aa  637    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3453  transcription-repair coupling factor  34.86 
 
 		 1122 aa  646    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0209077 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  38.14 
 
 		 1162 aa  709    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  38.14 
 
 		 1162 aa  711    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  100 
 
 		 1158 aa  2380    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  62.87 
 
 		 1180 aa  1541    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  46.19 
 
 		 1170 aa  1100    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  37.51 
 
 		 1169 aa  727    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  37.53 
 
 		 1196 aa  710    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1330  transcription-repair coupling factor  36.09 
 
 		 1148 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266348 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  39.23 
 
 		 1176 aa  734    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1237  transcription-repair coupling factor  35.55 
 
 		 1148 aa  646    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.792337  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25230  transcription-repair coupling factor  36.1 
 
 		 1148 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1998  transcription-repair coupling factor  35.82 
 
 		 1176 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0120843 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  35.26 
 
 		 1188 aa  637    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  36.87 
 
 		 1165 aa  679    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  35.95 
 
 		 1179 aa  662    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  36.87 
 
 		 1168 aa  683    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1245  transcription-repair coupling factor  35.2 
 
 		 1222 aa  640    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  37.52 
 
 		 1189 aa  656    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1494  transcription-repair coupling factor  35.73 
 
 		 1148 aa  647    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44461  normal  0.168665 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  36.18 
 
 		 1157 aa  672    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1913  transcription-repair coupling factor  38.01 
 
 		 1192 aa  656    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  37.9 
 
 		 1177 aa  686    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2209  transcription-repair coupling factor  35.55 
 
 		 1148 aa  646    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  34.89 
 
 		 1155 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  35.55 
 
 		 1224 aa  662    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2487  transcription-repair coupling factor  35.55 
 
 		 1164 aa  647    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203456  hitchhiker  0.00300257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4331  transcription-repair coupling factor  36.48 
 
 		 1211 aa  669    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.376638 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  51.4 
 
 		 1169 aa  1233    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4777  transcription-repair coupling factor  35.24 
 
 		 1212 aa  659    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  36.7 
 
 		 1173 aa  638    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>