More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4150 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  65.08 
 
 		 191 aa  261  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 205 aa  197  7.999999999999999e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  50.78 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 289 aa  179  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  41.62 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 226 aa  104  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 228 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 209 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  28.41 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  33.14 
 
 		 220 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 226 aa  81.3  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 244 aa  81.3  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  33.12 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  34.31 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  30.32 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 216 aa  72  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 222 aa  71.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  32.82 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  29.45 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  32.06 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 540 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
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NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  29.25 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
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