49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4118 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  98.87 
 
 
533 aa  1047    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  100 
 
 
533 aa  1056    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  51.69 
 
 
526 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  38.57 
 
 
535 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  37.38 
 
 
532 aa  340  2.9999999999999998e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  37.35 
 
 
528 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  37.15 
 
 
528 aa  303  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  37.22 
 
 
517 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  34.2 
 
 
546 aa  283  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  36.27 
 
 
547 aa  267  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  32.78 
 
 
546 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  32.78 
 
 
546 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  30.15 
 
 
543 aa  204  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  27.51 
 
 
569 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  31.93 
 
 
557 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  34.29 
 
 
592 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  34.29 
 
 
592 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  28.81 
 
 
605 aa  73.9  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  29.19 
 
 
618 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  27.57 
 
 
536 aa  67.4  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  33.15 
 
 
516 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  33.15 
 
 
516 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  33.15 
 
 
516 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  33.15 
 
 
516 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4315  hypothetical protein  25.37 
 
 
558 aa  62  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248191  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  39.36 
 
 
492 aa  60.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  23.55 
 
 
618 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  32.6 
 
 
516 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  27.85 
 
 
534 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  28 
 
 
557 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  28 
 
 
557 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
513 aa  57.4  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  29.94 
 
 
531 aa  57  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  29.21 
 
 
658 aa  57  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  27.27 
 
 
563 aa  57  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  28.76 
 
 
531 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  28.85 
 
 
529 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  25.43 
 
 
616 aa  54.3  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  25.53 
 
 
564 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
510 aa  51.6  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  26.36 
 
 
607 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  30.73 
 
 
544 aa  50.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  23.51 
 
 
507 aa  50.8  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  25.85 
 
 
729 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  29.41 
 
 
506 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  22.94 
 
 
558 aa  45.8  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  38.96 
 
 
727 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4896  hypothetical protein  26.7 
 
 
638 aa  44.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303518  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  24.28 
 
 
588 aa  43.9  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>