More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4112 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  100 
 
 
147 aa  299  8e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  100 
 
 
147 aa  299  8e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  70.34 
 
 
148 aa  223  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  68.53 
 
 
148 aa  212  1e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  66.19 
 
 
148 aa  196  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  52.55 
 
 
139 aa  162  1e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  51.82 
 
 
148 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  53.28 
 
 
139 aa  158  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  54.81 
 
 
150 aa  157  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  51.82 
 
 
148 aa  155  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  49.29 
 
 
181 aa  153  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  52.55 
 
 
145 aa  152  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  50.36 
 
 
146 aa  150  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  54.81 
 
 
150 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  54.81 
 
 
150 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  54.81 
 
 
150 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  54.81 
 
 
150 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  54.81 
 
 
150 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  54.81 
 
 
150 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  54.81 
 
 
150 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  52.55 
 
 
148 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  51.09 
 
 
143 aa  147  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.64 
 
 
146 aa  146  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  48.18 
 
 
154 aa  146  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  48.18 
 
 
165 aa  146  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  53.33 
 
 
150 aa  145  1e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  47.45 
 
 
154 aa  144  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  50.37 
 
 
147 aa  144  4e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  50.37 
 
 
148 aa  144  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  49.63 
 
 
150 aa  143  7e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  48.18 
 
 
145 aa  142  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  47.79 
 
 
149 aa  139  1e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  46.67 
 
 
145 aa  139  2e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  46.21 
 
 
146 aa  139  2e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  43.54 
 
 
146 aa  138  2e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  43.07 
 
 
153 aa  138  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  45.99 
 
 
145 aa  136  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  45.39 
 
 
148 aa  135  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  44.85 
 
 
144 aa  134  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  43.8 
 
 
149 aa  133  6e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  48.57 
 
 
151 aa  133  6e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  43.38 
 
 
146 aa  132  2e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  43.38 
 
 
146 aa  131  2e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  44.29 
 
 
150 aa  129  9e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  43.57 
 
 
152 aa  129  1e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  42.34 
 
 
146 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  41.48 
 
 
147 aa  127  7e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  41.48 
 
 
147 aa  127  7e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  41.48 
 
 
147 aa  127  7e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  42.75 
 
 
145 aa  124  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  43.8 
 
 
150 aa  123  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  40.14 
 
 
146 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  41.61 
 
 
148 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  45.26 
 
 
144 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  37.78 
 
 
144 aa  120  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  41.43 
 
 
151 aa  120  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  39.71 
 
 
151 aa  119  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  47.73 
 
 
162 aa  119  1e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  46.97 
 
 
162 aa  116  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  40.28 
 
 
151 aa  115  1e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  7.6493e-05 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  42.65 
 
 
144 aa  115  2e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  39.44 
 
 
149 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  40.29 
 
 
160 aa  112  1e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  37.96 
 
 
148 aa  113  1e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  42.06 
 
 
152 aa  110  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  41.35 
 
 
149 aa  110  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  43.8 
 
 
149 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  39.57 
 
 
155 aa  110  8e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  43.18 
 
 
153 aa  109  1e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  40.3 
 
 
146 aa  109  1e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0458  response regulator receiver  39.26 
 
 
151 aa  108  2e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  43.18 
 
 
153 aa  109  2e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2819  response regulator receiver protein  36.88 
 
 
147 aa  108  2e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0636821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  39.71 
 
 
153 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  38.89 
 
 
151 aa  107  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  42.54 
 
 
153 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  44.53 
 
 
173 aa  105  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3679  response regulator receiver protein  39.55 
 
 
135 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.57333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  40.15 
 
 
145 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  37.06 
 
 
153 aa  105  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  37.76 
 
 
148 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  39.39 
 
 
147 aa  104  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
156 aa  104  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  35.77 
 
 
171 aa  104  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
164 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  39.39 
 
 
153 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  40.44 
 
 
149 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
155 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  37.23 
 
 
144 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4530  response regulator receiver protein  37.41 
 
 
146 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  40.85 
 
 
152 aa  100  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  36.69 
 
 
145 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  37.12 
 
 
146 aa  100  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  31.47 
 
 
154 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  38.97 
 
 
147 aa  100  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  31.16 
 
 
155 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  38.64 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  38.64 
 
 
153 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  31.88 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  38.64 
 
 
153 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.484722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>