More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4108 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  89.62 
 
 
472 aa  816    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  100 
 
 
472 aa  934    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  34.74 
 
 
383 aa  189  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  31.5 
 
 
447 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  30.07 
 
 
420 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  31.91 
 
 
453 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  29.34 
 
 
454 aa  180  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  30.27 
 
 
442 aa  180  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.52 
 
 
382 aa  179  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  31.41 
 
 
450 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  30.98 
 
 
376 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  29.54 
 
 
455 aa  179  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  31.55 
 
 
444 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  29.4 
 
 
376 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  31.25 
 
 
456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  30.02 
 
 
450 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  30.97 
 
 
408 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  31.99 
 
 
456 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  30.02 
 
 
408 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  28.22 
 
 
453 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  27.07 
 
 
483 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.11 
 
 
441 aa  158  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  29.61 
 
 
402 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  27.56 
 
 
463 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  28.47 
 
 
463 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1532  chromate transporter  29.12 
 
 
452 aa  143  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  27.41 
 
 
428 aa  143  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.02 
 
 
469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.64 
 
 
441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  27.16 
 
 
467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  26.48 
 
 
454 aa  139  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.67 
 
 
467 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.01 
 
 
404 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.28 
 
 
469 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  40.54 
 
 
389 aa  136  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.29 
 
 
393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  39.05 
 
 
393 aa  130  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45 
 
 
387 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  25.61 
 
 
462 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0300  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.95 
 
 
467 aa  126  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.76 
 
 
392 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.29 
 
 
387 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  25.84 
 
 
461 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.07 
 
 
391 aa  121  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.13 
 
 
469 aa  120  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  26.97 
 
 
430 aa  120  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  41.26 
 
 
379 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.31 
 
 
450 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  27.69 
 
 
346 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  27.75 
 
 
397 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  37.11 
 
 
446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  39.02 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.69 
 
 
386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  26.63 
 
 
454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  26.63 
 
 
454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  28.13 
 
 
409 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0797  chromate transporter  36.18 
 
 
451 aa  111  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  38.85 
 
 
398 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11551  chromate transporter  44.55 
 
 
412 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0167365 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0443  chromate transporter  45.54 
 
 
412 aa  110  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.4 
 
 
457 aa  109  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  35.85 
 
 
445 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.35 
 
 
447 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  35.22 
 
 
416 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  42.19 
 
 
174 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  31.61 
 
 
460 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  36.53 
 
 
397 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.26 
 
 
395 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  36.17 
 
 
456 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  40.48 
 
 
394 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  35.1 
 
 
392 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  42.74 
 
 
382 aa  106  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  40.65 
 
 
167 aa  106  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  39.29 
 
 
174 aa  106  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  37.09 
 
 
396 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  35.1 
 
 
392 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  39.44 
 
 
401 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  38.03 
 
 
401 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  36.42 
 
 
396 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  40.16 
 
 
393 aa  104  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  36.42 
 
 
396 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  32.96 
 
 
428 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  40 
 
 
401 aa  104  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  37.5 
 
 
385 aa  104  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  29.63 
 
 
469 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  35.12 
 
 
390 aa  103  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  36.42 
 
 
396 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  25.13 
 
 
398 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  40.94 
 
 
376 aa  103  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2804  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.06 
 
 
470 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  30.86 
 
 
443 aa  101  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  38.03 
 
 
418 aa  101  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  36.42 
 
 
187 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  36.42 
 
 
187 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.28 
 
 
390 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  26.33 
 
 
395 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  38.93 
 
 
188 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  38.93 
 
 
188 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.28 
 
 
390 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.01 
 
 
407 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>