More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4069 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 417 aa  820    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  76.87 
 
 		 419 aa  651    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 417 aa  820    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  61.5 
 
 		 426 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  57.57 
 
 		 438 aa  495  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  58.75 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  57.45 
 
 		 421 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2623  rod shape-determining protein RodA  57.44 
 
 		 437 aa  469  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  49.74 
 
 		 412 aa  358  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  48.71 
 
 		 412 aa  357  2.9999999999999997e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  48.72 
 
 		 427 aa  335  7e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20261  cell division membrane protein  45.8 
 
 		 424 aa  325  9e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.36733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1152  cell division membrane protein  45.8 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  45.05 
 
 		 422 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  43.75 
 
 		 422 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  43.16 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  44.01 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17001  cell division membrane protein  46.96 
 
 		 426 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.746049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  45.89 
 
 		 377 aa  264  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  41.78 
 
 		 380 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  39.39 
 
 		 365 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  41.24 
 
 		 378 aa  243  7e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  39.38 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  43.3 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  41.3 
 
 		 388 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  40.59 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  35.7 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  34.58 
 
 		 373 aa  223  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  37.05 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  32.85 
 
 		 369 aa  216  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  35.93 
 
 		 374 aa  215  9e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  36.91 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  34.31 
 
 		 371 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  35.43 
 
 		 407 aa  211  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  38.5 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  33.82 
 
 		 369 aa  207  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  36.01 
 
 		 405 aa  207  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  36.63 
 
 		 371 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  35.73 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  35.1 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  34.98 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  32.41 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  32.93 
 
 		 379 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  32.93 
 
 		 379 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  37.29 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  34.99 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  33.49 
 
 		 386 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  37.25 
 
 		 367 aa  202  7e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  36.97 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  36.97 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  35.77 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  36.97 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  36.97 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  36.36 
 
 		 376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  36.72 
 
 		 372 aa  201  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  34.7 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  36.97 
 
 		 367 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  36.97 
 
 		 367 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  41.48 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  33.67 
 
 		 366 aa  200  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  35.25 
 
 		 384 aa  200  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  35.64 
 
 		 366 aa  199  6e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  35.11 
 
 		 373 aa  199  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  36.09 
 
 		 384 aa  199  7.999999999999999e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  35.18 
 
 		 368 aa  199  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  36.47 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  37.46 
 
 		 407 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  38.78 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  33.61 
 
 		 368 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  35.85 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2186  Sfr protein  35.17 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117598  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  35.55 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  31.37 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  35.88 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  33.58 
 
 		 374 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  33.89 
 
 		 385 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  36.71 
 
 		 411 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  32.39 
 
 		 433 aa  196  6e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  33.9 
 
 		 403 aa  196  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  33.9 
 
 		 364 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  34.31 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  35.39 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  34.98 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1377  cell cycle protein  35.03 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  32.67 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  33.5 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0941  rod shape-determining protein RodA  37 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  35.88 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  34.38 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  35.86 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  33.59 
 
 		 389 aa  194  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0292  cell cycle protein  39.06 
 
 		 413 aa  193  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1919  rod shape-determining protein RodA  35.1 
 
 		 360 aa  193  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403487  hitchhiker  0.000000909205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  35.31 
 
 		 368 aa  193  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  32.67 
 
 		 388 aa  192  7e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  33.51 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  34.27 
 
 		 371 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  33.51 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  33.8 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  35.56 
 
 		 366 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>