More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3869 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3869  succinyldiaminopimelate transaminase  100 
 
 
392 aa  805    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3918  succinyldiaminopimelate transaminase  97.7 
 
 
392 aa  792    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000686397  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  72.94 
 
 
388 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  71.9 
 
 
400 aa  582  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0159  succinyldiaminopimelate transaminase  70.3 
 
 
407 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.899498  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5101  succinyldiaminopimelate transaminase  70.77 
 
 
390 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.26447 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0944  succinyldiaminopimelate transaminase  68.81 
 
 
390 aa  553  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.989177  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1794  succinyldiaminopimelate transaminase  64.27 
 
 
392 aa  527  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.455812  decreased coverage  0.0036927 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3010  aminotransferase class I and II  44.41 
 
 
388 aa  341  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0774933 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  43.46 
 
 
384 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  40.67 
 
 
389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  43.67 
 
 
388 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.19 
 
 
385 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  42.67 
 
 
388 aa  333  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1758  aminotransferase, class I and II  45.99 
 
 
391 aa  330  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3182  aminotransferase class I and II  46.44 
 
 
384 aa  328  8e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0525687  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  41.88 
 
 
382 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.38 
 
 
389 aa  322  6e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  40.73 
 
 
382 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  40.31 
 
 
390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.31 
 
 
388 aa  320  3e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.36 
 
 
385 aa  319  5e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.67 
 
 
391 aa  315  9e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  38.66 
 
 
394 aa  311  9e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.86 
 
 
390 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1774  aminotransferase  41.46 
 
 
396 aa  311  2e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.472622  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.79 
 
 
388 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  40.05 
 
 
382 aa  310  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.34 
 
 
389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  39.48 
 
 
382 aa  310  4e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  40.16 
 
 
388 aa  308  9e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  44.22 
 
 
387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  40.72 
 
 
411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  38.8 
 
 
391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.7 
 
 
388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  38.28 
 
 
399 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  40.42 
 
 
400 aa  302  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  38.28 
 
 
399 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  40.62 
 
 
405 aa  302  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  41.15 
 
 
411 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  38.65 
 
 
395 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  38.02 
 
 
399 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  40.89 
 
 
418 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  40.62 
 
 
403 aa  301  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  38.4 
 
 
397 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.66 
 
 
392 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  39.43 
 
 
411 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  39.43 
 
 
411 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  39.43 
 
 
411 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  38.02 
 
 
400 aa  298  8e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  39.18 
 
 
401 aa  298  8e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  39.58 
 
 
411 aa  298  8e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  37.5 
 
 
399 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  40.16 
 
 
393 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  40.16 
 
 
393 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  39.9 
 
 
392 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.69 
 
 
391 aa  297  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  39.84 
 
 
402 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  39.58 
 
 
402 aa  296  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  39.39 
 
 
411 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  37.76 
 
 
400 aa  296  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23430  Aminotransferase, class I and II  40 
 
 
414 aa  296  5e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  38.02 
 
 
399 aa  296  5e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  38.02 
 
 
399 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  39.28 
 
 
412 aa  296  6e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  38.02 
 
 
400 aa  295  7e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  37.76 
 
 
399 aa  295  8e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  37.24 
 
 
399 aa  295  8e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0168  aminotransferase class I and II  36.78 
 
 
403 aa  295  9e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.391722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  39.18 
 
 
402 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  37.5 
 
 
394 aa  294  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  39.02 
 
 
412 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  37.08 
 
 
404 aa  294  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  40.16 
 
 
391 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  39.32 
 
 
411 aa  294  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  37.82 
 
 
405 aa  294  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  39.18 
 
 
402 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  41.3 
 
 
395 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  38.62 
 
 
412 aa  293  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  39.32 
 
 
402 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  39.02 
 
 
412 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  39.02 
 
 
412 aa  293  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  39.02 
 
 
412 aa  293  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1106  aspartate aminotransferase  36.99 
 
 
411 aa  293  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  39.02 
 
 
412 aa  293  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  39.58 
 
 
394 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  39.02 
 
 
412 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  38.58 
 
 
403 aa  293  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.69 
 
 
390 aa  293  5e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  39.06 
 
 
407 aa  292  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  38.82 
 
 
386 aa  292  6e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  39.32 
 
 
402 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2583  aminotransferase  39.06 
 
 
409 aa  292  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117889  normal  0.0369649 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  39.28 
 
 
412 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  39.28 
 
 
412 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  39.28 
 
 
412 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  39.28 
 
 
412 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  39.28 
 
 
412 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  38.85 
 
 
390 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  38.68 
 
 
402 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>