41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3802 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3802  transcriptional regulator  100 
 
 
126 aa  258  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3854  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  258  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1444  transcriptional regulator  86.07 
 
 
124 aa  221  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3125  transcriptional regulator AbrB  79.82 
 
 
137 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4400  hypothetical protein  83.48 
 
 
121 aa  194  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000505081  normal  0.726686 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1859  transcriptional regulator AbrB  79.82 
 
 
140 aa  191  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2180  hypothetical protein  77.19 
 
 
137 aa  189  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2255  hypothetical protein  57.38 
 
 
134 aa  147  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0192999  normal  0.0349457 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1969  transcriptional regulator AbrB  54.4 
 
 
125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0405  transcriptional regulator, AbrB family  54.55 
 
 
133 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.270466  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0396  transcriptional regulator, AbrB family  53.72 
 
 
133 aa  133  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0524  AbrB family transcriptional regulator  53.78 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0061  transcriptional regulator AbrB  53.78 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5329  transcriptional regulator, AbrB family  52.94 
 
 
134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0216  AbrB family transcriptional regulator  51.24 
 
 
137 aa  130  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.932065  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1805  hypothetical protein  51.69 
 
 
129 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.730454  normal  0.343994 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18171  hypothetical protein  51.24 
 
 
123 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06381  hypothetical protein  55.86 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0573  transcriptional regulator AbrB  55.86 
 
 
118 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.432889  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06291  transciptional regulator  55.86 
 
 
118 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05761  hypothetical protein  51.24 
 
 
122 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0493  hypothetical protein  51.33 
 
 
144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.514631  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0897  hypothetical protein  49.59 
 
 
123 aa  117  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05991  transcriptional regulator AbrB  54.05 
 
 
118 aa  114  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0708  hypothetical protein  52.59 
 
 
129 aa  114  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1525  hypothetical protein  49.17 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.140017  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0411  transciptional regulator  49.55 
 
 
118 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11061  hypothetical protein  49.55 
 
 
118 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1463  hypothetical protein  47.93 
 
 
122 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0991  transcriptional regulator AbrB  49.59 
 
 
123 aa  104  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1413  hypothetical protein  47.93 
 
 
122 aa  103  7e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.48166 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06391  hypothetical protein  41.12 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0770948 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05051  hypothetical protein  42.06 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0340173  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04401  hypothetical protein  40.19 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04981  hypothetical protein  41.12 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.746916  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04971  hypothetical protein  38.32 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0442  transcriptional regulator AbrB  41.12 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288973  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1774  transcriptional regulator AbrB  38.32 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102447  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04671  hypothetical protein  39.25 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0605  transcriptional regulator AbrB  35.51 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.295719  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1757  transcriptional regulator AbrB  39.05 
 
 
138 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>