85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3690 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  100 
 
 
291 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  99.31 
 
 
291 aa  585  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  58.19 
 
 
288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  42.59 
 
 
291 aa  206  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  43.99 
 
 
286 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  40.41 
 
 
296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  37.75 
 
 
299 aa  189  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  39.55 
 
 
325 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  38.89 
 
 
454 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  31.85 
 
 
302 aa  122  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  29.33 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  32 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  31.58 
 
 
305 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  30.54 
 
 
302 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  26.28 
 
 
304 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  27.92 
 
 
312 aa  102  6e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  26.85 
 
 
306 aa  102  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  32.92 
 
 
306 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  28.57 
 
 
302 aa  99  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  26.19 
 
 
305 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  28.9 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  29.37 
 
 
303 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  28.47 
 
 
305 aa  95.5  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  28.2 
 
 
296 aa  95.5  9e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  28.78 
 
 
306 aa  95.5  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  29.73 
 
 
310 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  29.73 
 
 
310 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  35.9 
 
 
349 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  27.56 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  24.84 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  24.84 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  24.84 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  33.77 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  24.68 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  33.1 
 
 
493 aa  76.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  32.16 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  24.76 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  24.67 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  37.4 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  24.44 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  25.59 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  24.42 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  30 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  30 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  35.29 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  24.64 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  35.9 
 
 
368 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  29.93 
 
 
374 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  25 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  26.58 
 
 
297 aa  62.4  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  36.52 
 
 
421 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  30.3 
 
 
222 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  33.08 
 
 
237 aa  56.6  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  33.62 
 
 
799 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  33.62 
 
 
799 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  29.91 
 
 
326 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  27.54 
 
 
447 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  30.63 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  36.45 
 
 
219 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  29.37 
 
 
128 aa  53.1  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  33.04 
 
 
250 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  36.78 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  28.24 
 
 
349 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  32.8 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  31.65 
 
 
154 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  31.65 
 
 
154 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  31.65 
 
 
154 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  28.57 
 
 
454 aa  48.9  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  30.37 
 
 
345 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  30.93 
 
 
585 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  22.22 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  28.47 
 
 
184 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  33.06 
 
 
125 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  29.71 
 
 
454 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  31.82 
 
 
450 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4097  restriction endonuclease  26.45 
 
 
208 aa  46.2  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  30.43 
 
 
193 aa  46.2  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  27.94 
 
 
454 aa  45.8  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  26.77 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  29.37 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0325  restriction endonuclease  27.27 
 
 
196 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383479 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  27.54 
 
 
454 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  28.26 
 
 
455 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2800  restriction endonuclease  24.53 
 
 
207 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  33.01 
 
 
403 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>