More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3602 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  71.22 
 
 		 513 aa  716    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  98.39 
 
 		 497 aa  1006    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 497 aa  1019    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  66.73 
 
 		 502 aa  686    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  75.66 
 
 		 506 aa  766    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  49.39 
 
 		 504 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  46.08 
 
 		 515 aa  425  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  47.65 
 
 		 512 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  46.82 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  44.26 
 
 		 512 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  40.67 
 
 		 595 aa  371  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  40.64 
 
 		 554 aa  354  2e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  39.92 
 
 		 509 aa  339  5e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  40.12 
 
 		 509 aa  339  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  38.68 
 
 		 509 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  38.48 
 
 		 509 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  38.08 
 
 		 509 aa  336  7e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  39.08 
 
 		 509 aa  330  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  40.12 
 
 		 516 aa  325  8.000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  40 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  38.45 
 
 		 645 aa  317  4e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  38.68 
 
 		 510 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  37.67 
 
 		 598 aa  302  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  36.11 
 
 		 530 aa  293  5e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  34.93 
 
 		 520 aa  292  8e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  35.54 
 
 		 512 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  35.54 
 
 		 512 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  35.5 
 
 		 506 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  36.64 
 
 		 508 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  37.24 
 
 		 633 aa  278  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  34.68 
 
 		 506 aa  277  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 		 532 aa  276  6e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  33.87 
 
 		 503 aa  276  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  33.86 
 
 		 516 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  35.2 
 
 		 507 aa  274  3e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  34.65 
 
 		 518 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  33.33 
 
 		 520 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  34.06 
 
 		 508 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 		 503 aa  270  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  33.13 
 
 		 520 aa  269  7e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  33.86 
 
 		 518 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  33.74 
 
 		 505 aa  269  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  34.14 
 
 		 504 aa  266  5.999999999999999e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  33.47 
 
 		 522 aa  265  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  32.67 
 
 		 503 aa  261  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  31.49 
 
 		 514 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  31.29 
 
 		 514 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  31.49 
 
 		 514 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  31.57 
 
 		 514 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  36.05 
 
 		 635 aa  235  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  26.71 
 
 		 938 aa  177  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  29.4 
 
 		 504 aa  143  8e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  28.06 
 
 		 505 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  25.59 
 
 		 518 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  27.76 
 
 		 499 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  27.76 
 
 		 499 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 717 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  26.67 
 
 		 499 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  27.59 
 
 		 492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  26.13 
 
 		 507 aa  127  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  28.74 
 
 		 523 aa  126  9e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  25.77 
 
 		 512 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.45 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  27.2 
 
 		 510 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  25.15 
 
 		 493 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.53 
 
 		 740 aa  124  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  25.25 
 
 		 511 aa  123  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  27.27 
 
 		 535 aa  123  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  27.31 
 
 		 518 aa  121  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 554 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.35 
 
 		 511 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  25.09 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  25.58 
 
 		 518 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  25.39 
 
 		 504 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  25.83 
 
 		 517 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  25.58 
 
 		 518 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  26.83 
 
 		 708 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 547 aa  116  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 722 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  26.69 
 
 		 711 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 		 554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.37 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  26.28 
 
 		 552 aa  115  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  25.3 
 
 		 489 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  26.31 
 
 		 494 aa  114  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 559 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.63 
 
 		 544 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  25.85 
 
 		 531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  23.02 
 
 		 537 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  24.66 
 
 		 498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 		 510 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  25.65 
 
 		 507 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  24.31 
 
 		 508 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  24.3 
 
 		 511 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  24.8 
 
 		 504 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  24.27 
 
 		 524 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  23.35 
 
 		 505 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  25.09 
 
 		 546 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>