28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3601 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3601  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  274  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2513  hypothetical protein  95.45 
 
 
132 aa  266  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2291  hypothetical protein  65.85 
 
 
125 aa  187  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0242262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4269  hypothetical protein  66.67 
 
 
128 aa  175  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.237355 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0014  hypothetical protein  61.6 
 
 
130 aa  164  3e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.51836  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1222  hypothetical protein  58.54 
 
 
125 aa  163  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.987137  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2085  hypothetical protein  59.35 
 
 
129 aa  157  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00513635  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1258  hypothetical protein  42.28 
 
 
137 aa  127  7e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.503521  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4834  hypothetical protein  33.86 
 
 
139 aa  78.6  3e-14  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0531  hypothetical protein  36.15 
 
 
139 aa  76.6  1e-13  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_10591  predicted protein  29.29 
 
 
99 aa  76.3  1e-13  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120478  normal  0.660881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4691  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  71.2  4e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220127  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1403  hypothetical protein  33.91 
 
 
149 aa  69.7  1e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40872  predicted protein  30.61 
 
 
363 aa  48.9  3e-05  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.471917 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  25.27 
 
 
156 aa  48.5  3e-05  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  5.63714e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49656  predicted protein  26.98 
 
 
399 aa  47  8e-05  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  26.17 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  22.86 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  25.71 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  26.42 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  28.32 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31684  predicted protein  25.24 
 
 
231 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  23.42 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  21.9 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  27.83 
 
 
146 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  25.86 
 
 
148 aa  41.2  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  30.11 
 
 
147 aa  41.2  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  26.13 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>