More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3579 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3579  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 360 aa  728    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2534  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 360 aa  728    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.113994 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1008  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.52 
 
 		 366 aa  508  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000228051  hitchhiker  0.00140746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.35 
 
 		 366 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0582053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1892  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.82 
 
 		 371 aa  493  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1365  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.05 
 
 		 386 aa  489  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2503  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.57 
 
 		 370 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.54699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0835  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.07 
 
 		 375 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0909626  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0162  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.94 
 
 		 347 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0118  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.53 
 
 		 348 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01931  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.68 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.9 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.09 
 
 		 335 aa  394  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.57 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.08 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.23 
 
 		 541 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.32 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.5 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 336 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 336 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1192  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.51 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.06 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.81 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.46 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.16 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20671  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.51 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.85 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.56 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 		 337 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.59 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 		 337 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.5 
 
 		 342 aa  388  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 330 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  56.11 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.11 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.11 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  56.11 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.11 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.11 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 		 336 aa  381  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.73 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.11 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.19 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.8 
 
 		 335 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.11 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.11 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.82 
 
 		 334 aa  381  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.35 
 
 		 337 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.74 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.52 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  56 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.8 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.21 
 
 		 347 aa  378  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.52 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.82 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.8 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.22 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.13 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.12 
 
 		 334 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.82 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.8 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.07 
 
 		 337 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.82 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.8 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.52 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.38 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.25 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.8 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.71 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.86 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.94 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.62 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.05 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.01 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  55.59 
 
 		 341 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 334 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.63 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.88 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.41 
 
 		 351 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.52 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.05 
 
 		 355 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.71 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 		 335 aa  375  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.22 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.95 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.91 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.84 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.13 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.87 
 
 		 339 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.65 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>